More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1152 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2533  LysR family transcriptional regulator  99.06 
 
 		 320 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1305  LysR family transcriptional regulator  98.75 
 
 		 320 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1152  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0699  LysR family transcriptional regulator  98.75 
 
 		 320 aa  641    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1144  LysR family transcriptional regulator  99.38 
 
 		 320 aa  646    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2081  LysR family transcriptional regulator  99.06 
 
 		 320 aa  644    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1251  LysR family transcriptional regulator  83.28 
 
 		 318 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.392675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2065  LysR family transcriptional regulator  83.91 
 
 		 318 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1223  LysR family transcriptional regulator  83.28 
 
 		 318 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0770  LysR family transcriptional regulator  83.28 
 
 		 318 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4389  LysR family transcriptional regulator  82.02 
 
 		 318 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1142  LysR family transcriptional regulator  82.08 
 
 		 318 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1130  LysR family transcriptional regulator  82.08 
 
 		 318 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  73.9 
 
 		 323 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  73.9 
 
 		 323 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  73.9 
 
 		 323 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  73.9 
 
 		 323 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0099  LysR family transcriptional regulator  73.45 
 
 		 277 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1101  LysR family transcriptional regulator  73.45 
 
 		 277 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0325  LysR family transcriptional regulator  73.45 
 
 		 277 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3898  LysR family transcriptional regulator  64.07 
 
 		 311 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2032  LysR family transcriptional regulator  62.13 
 
 		 302 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3902  LysR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2847  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2070  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7812  transcriptional regulator, LysR family  40.55 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4670  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 317 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  hitchhiker  0.00186288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1244  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0599  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  28.79 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0011  LysR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  25.45 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0045  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3260  LysR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.444883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2682  LysR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3562  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0047  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4480  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.678379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3191  LysR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0063  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0024  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2769  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0236  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3228  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155209 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3502  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2679  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.626987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1873  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0024  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 320 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0927  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3310  LysR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.637496  normal  0.0770151 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0044  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0026  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 308 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 299 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5397  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal  0.012277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2988  transcriptional regulator, LysR family  25.39 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.8288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3395  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0602491  normal  0.492377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2922  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5641  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3435  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6562  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  27.64 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0147  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  22.3 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  24.81 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0475  transcriptional regulator, LysR family  20.45 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2418  transcriptional regulator, LysR family  25.44 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2778  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  28.18 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0084  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446413  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1191  putative transcriptional regulator  23.33 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  26.35 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  23.97 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3153  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00364917  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0843  LysR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5762  LysR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0367  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>