More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0475 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0475  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  59.93 
 
 		 293 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6474  LysR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 327 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.254118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  30.24 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 307 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  26.14 
 
 		 303 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5945  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.34 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  22.55 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  26.32 
 
 		 301 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3039  rubisco operon transcriptional regulator  26.64 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.670925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  22.92 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5950  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2710  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3406  transcriptional regulator, LysR family  27.3 
 
 		 309 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0044  LysR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2915  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 305 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.4 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  23.97 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  27.97 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  26.36 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5931  LysR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145733  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  24.59 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  22.83 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3716  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3638  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000174199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0048  transcriptional regulator, LysR family  23.95 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.968768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5512  transcriptional regulator, LysR family  24.6 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4477  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 302 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 295 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0171  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0114  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3723  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 322 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162461  hitchhiker  0.00150053 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02040  transcriptional regulator, LysR family  22.18 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.65232  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3755  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0901244  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3436  LysR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4466  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0334  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 301 aa  93.2  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000502074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08961  transcriptional regulator, LysR family protein  27.67 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4198  LysR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.982202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2022  LysR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0620122  normal  0.0797415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0687  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 311 aa  92.8  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.591422  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1223  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0770  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1251  LysR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6041  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 308 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756462  hitchhiker  0.00133745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  26.51 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03773  transcriptional regulator LysR family  23.32 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3968  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.456128  normal  0.373765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1326  LysR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 322 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138103  normal  0.40975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6168  putative transcriptional regulator  23.92 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220915  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3855  transcriptional regulator, LysR family  24.41 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  24.5 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71750  LysR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0620  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.37658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2695  LysR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.537624  normal  0.689503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6226  putative transcriptional regulator  22.97 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71090  LysR family transcriptional regulator  23.33 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3467  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.39067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  21.43 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5348  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1047  LysR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00687136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4389  LysR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 318 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0852  LysR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3033  transcriptional regulator, LysR family  26.21 
 
 		 325 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0089298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5126  LysR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5257  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>