More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0447 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0447  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
217 aa  434  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0667  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  55.56 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1722  methionine import ATP-binding protein MetN  54.25 
 
 
217 aa  232  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1305  ABC transporter-related protein  50.48 
 
 
212 aa  205  4e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000307697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1564  ABC transporter related  49.28 
 
 
284 aa  201  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239809  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.24 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30.88 
 
 
369 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0451  ABC transporter related  36.32 
 
 
234 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000589964  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  29.44 
 
 
296 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0521  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.88 
 
 
333 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0208904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  31.43 
 
 
311 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  28.77 
 
 
284 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  34.13 
 
 
318 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2015  heme exporter protein CcmA  32.86 
 
 
289 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  30.09 
 
 
311 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  29.44 
 
 
233 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  31.16 
 
 
231 aa  102  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
275 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  33.17 
 
 
294 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.73 
 
 
298 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  33.02 
 
 
300 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  32.14 
 
 
304 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  33.33 
 
 
368 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
368 aa  101  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  31.1 
 
 
287 aa  102  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  33.33 
 
 
366 aa  101  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1457  ABC transporter-like protein  30.63 
 
 
498 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
242 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 
300 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl450  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  39.9 
 
 
235 aa  100  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  2.06061e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
242 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
311 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 
308 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.37 
 
 
323 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  32.26 
 
 
316 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.31 
 
 
325 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  31.47 
 
 
254 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3233  ABC transporter related  31.76 
 
 
500 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.405741  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  29.82 
 
 
250 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  29.91 
 
 
277 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  32.87 
 
 
308 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0454  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 
333 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0697  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
536 aa  99.8  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf575  ABC transporter ATP-binding protein  34.7 
 
 
321 aa  99.8  3e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0450805  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0296  ABC transporter related  34.43 
 
 
510 aa  99.8  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000067661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  30.88 
 
 
309 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.64 
 
 
310 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06990  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.95 
 
 
292 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0435  ABC transporter related  29.86 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
242 aa  99  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2990  ABC transporter ATP-binding protein  31.51 
 
 
231 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.829881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  36.73 
 
 
258 aa  98.6  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  30 
 
 
314 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2191  ABC transporter related  28.18 
 
 
516 aa  98.6  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  28.23 
 
 
339 aa  98.6  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0469  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
240 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  32.86 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2504  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  30.18 
 
 
250 aa  98.2  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.020525  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0468  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
240 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  34.58 
 
 
306 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  28.7 
 
 
231 aa  98.2  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  31.78 
 
 
316 aa  98.2  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  32.6 
 
 
297 aa  98.2  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  30.81 
 
 
273 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  32.57 
 
 
240 aa  98.2  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1534  ABC transporter related  30.37 
 
 
259 aa  98.2  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.261317  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  31.73 
 
 
299 aa  98.2  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  30.59 
 
 
299 aa  98.2  9e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1078  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  30.56 
 
 
334 aa  97.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0354  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0337  glutamine transport, ATP-binding protein  32.57 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.410517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0340  glutamine transport, ATP-binding protein  32.57 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.474686  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  32.88 
 
 
308 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0403  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
240 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  33.18 
 
 
310 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1947  ribose import ATP-binding protein  32.46 
 
 
514 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0632394  hitchhiker  0.000243405 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2888  ABC transporter related  32.59 
 
 
316 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0399  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.28 
 
 
327 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  29.41 
 
 
331 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  29.49 
 
 
338 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  30.33 
 
 
268 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  30.14 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
240 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
286 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1068  ABC transporter related  33.33 
 
 
281 aa  96.7  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  32.11 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  30.73 
 
 
299 aa  97.1  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0797  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
234 aa  96.7  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00354056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  31.25 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1776  ABC transporter related  29.46 
 
 
597 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000473334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  26.79 
 
 
308 aa  96.7  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  31.94 
 
 
295 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0053  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.06 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  31.65 
 
 
292 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  31.19 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  30.14 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1969  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 
301 aa  97.1  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0565682  normal  0.106232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0655  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205588  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0688  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  32.02 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000562177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>