More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0408 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0408  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  591  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0201  cation-efflux system membrane protein  51.68 
 
 		 296 aa  291  8e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1466  putative integral membrane protein  51.68 
 
 		 296 aa  277  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1708  response regulator receiver  49.66 
 
 		 295 aa  276  4e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1595  DNA-binding response regulator, putative  52.19 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1780  DNA-binding response regulator, putative  51.85 
 
 		 295 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.756985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1962  DNA-binding response regulator, putative  51.85 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1488  response regulator receiver domain-containing protein  45.95 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.47127  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0244  conserved hypothetical protein, putative two-component response regulator  48.31 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2215  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1082  response regulator receiver protein  35.4 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  34.55 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2344  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.79 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0817  response regulator receiver: C terminal  35.59 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0415499  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1012  DNA-binding response regulator  35.59 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0213425  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2714  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0029  DNA-binding response regulator CzrR  33.93 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000398254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2388  heavy metal response regulator  30.36 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000142984  normal  0.119734 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2101  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  30.36 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0046  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.93 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398344  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.93 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3016  two component transcriptional regulator  31.58 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666033 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2149  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0043  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.93 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.955175  hitchhiker  0.00039578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2201  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.57 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.58 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0662  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00302199  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4696  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.86 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511164  decreased coverage  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.17 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4117  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.167574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.17 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  29.17 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.601271  hitchhiker  0.000975449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1629  two-component response regulator  27.19 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1461  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.2 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3965  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  23.74 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4465  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.46 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0436659 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.43 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0890  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000284562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.37 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1060  two component transcriptional regulator  23.94 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  28.7 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1354  two comoponent transcriptional regulator  29.82 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12417  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  32.74 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5210  two component response regulator  29.93 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0358  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1792  DNA-binding response regulator  35.65 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0238902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4231  DNA-binding response regulator TctD  23.74 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  26.15 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3049  two component transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3962  two component heavy metal response transcriptional regulator  29.82 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1760  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  31.3 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133831  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0664  two component transcriptional regulator  27.14 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0058  two component transcriptional regulator  28.32 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3523  two component transcriptional regulator  30.28 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  28.95 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2389  two component transcriptional regulator  26.92 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0850  two component response regulator  34.51 
 
 		 225 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.709175  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5978  regulatory protein CzcR  31.3 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000269255  normal  0.0723212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0670  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 464 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.2 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3569  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.59 
 
 		 235 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1608  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  27.19 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  28.7 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1420  winged helix family two component transcriptional regulator  24.42 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0489  response regulator for cobalt zinc cadmium resistance transcription regulator protein  29.73 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4933  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  29.82 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461594  normal  0.344735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1715  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  27.19 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4558  two component heavy metal response transcriptional regulator  33.04 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4391  two component transcriptional regulator  24.41 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748a  hypothetical protein  29.82 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0697031  normal  0.305387 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  28.95 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  25.89 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2855  DNA-binding transcriptional regulator PhoP  27.19 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  30.7 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4933  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.742602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  26.15 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  33.33 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>