97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1810 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1810  PepSY-associated TM helix family protein  100 
 
 
370 aa  732    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1802  putative oxidoreductase  40.1 
 
 
385 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2016  PepSY-associated TM helix family protein  34.59 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00288913  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0298  PepSY-associated TM helix family protein  30.51 
 
 
374 aa  169  9e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0757143  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2094  putative bifunctional protein: sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component; iron-uptake factor  30.65 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  27.2 
 
 
381 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  27.03 
 
 
840 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  25 
 
 
783 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.23 
 
 
850 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.23 
 
 
849 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.23 
 
 
850 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  24.74 
 
 
851 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  26.76 
 
 
822 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  24.4 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  25.4 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0764  PepSY-associated TM helix domain protein  25.2 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.346881  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  25.52 
 
 
850 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.24 
 
 
842 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  24.22 
 
 
850 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  22.84 
 
 
843 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  24.8 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0213  PepSY-associated TM helix domain protein  22.89 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  23.2 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  23.2 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  23.22 
 
 
840 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  24.58 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2775  PepSY-associated TM helix  23.43 
 
 
393 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.910277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4717  peptidase  23.33 
 
 
455 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292427  normal  0.0740605 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.21 
 
 
718 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.95767  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2121  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.38 
 
 
403 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0425818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  23.28 
 
 
844 aa  63.5  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1998  amino acid carrier family protein  22.6 
 
 
361 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4040  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.81 
 
 
369 aa  62.8  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0667  PepSY-associated TM helix  22.98 
 
 
405 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4895  peptidase  23 
 
 
455 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.606193  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3117  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.4 
 
 
456 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4839  hypothetical protein  23.33 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.387206  normal  0.379548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1313  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.67 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2949  hypothetical protein  25.46 
 
 
337 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3413  hypothetical protein  24.48 
 
 
380 aa  59.7  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4916  PepSY-associated TM helix domain protein  25 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.866851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0020  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  21.78 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2319  propeptide, PepSY amd peptidase M4  20.69 
 
 
461 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1718  PepSY-associated TM helix family protein  25.46 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.42 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1779  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.92 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.334456 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4069  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.97 
 
 
727 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.287082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3761  peptidase  22.08 
 
 
484 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2784  PepSY-associated TM helix domain protein  22.35 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000955959  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0971  hypothetical protein  23.64 
 
 
381 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4631  peptidase  23.67 
 
 
454 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0894362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.83 
 
 
849 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  21.21 
 
 
371 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0872  putative iron-regulated membrane protein  22.34 
 
 
348 aa  54.3  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11438  putative sulfite reductase flavoprotein component  24.44 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4883  hypothetical protein  23.33 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0595  hypothetical protein  22.11 
 
 
459 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.32 
 
 
885 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.45 
 
 
728 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0233  oxidoreductase, FAD-binding, putative  25.27 
 
 
734 aa  53.1  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4111  hypothetical protein  23.21 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911346  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.75 
 
 
892 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0607  PepSY-associated TM helix domain protein  22.65 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.861518  normal  0.0104892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2075  PepSY-associated TM helix domain protein  22.74 
 
 
411 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.668984  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4424  peptidase  22.62 
 
 
457 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  23.18 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  22.4 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5305  PepSY-associated TM helix domain protein  20.87 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0359696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3346  uncharacterized iron-regulated membrane protein  20.25 
 
 
411 aa  50.4  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1579  Propeptide PepSY amd peptidase M4  22.19 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0684  hypothetical protein  24.89 
 
 
406 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.15671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1822  PepSY-associated TM helix  20.45 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.646512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4253  PepSY-associated TM helix  21.83 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3757  iron uptake protein  21.76 
 
 
459 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.251046  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4063  peptidase  23.87 
 
 
489 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2884  hypothetical protein  22.53 
 
 
371 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.179346  hitchhiker  0.000404668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  21.96 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0201  peptidase  23.04 
 
 
451 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  21.59 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1027  hypothetical protein  20.98 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4883  hypothetical protein  28.77 
 
 
457 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4555  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.25 
 
 
403 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  21.68 
 
 
844 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1911  hypothetical protein  28.11 
 
 
426 aa  47  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.134613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0257  sulfite reductase/membrane protein  25.35 
 
 
391 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.748657  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0200  transmembrane protein  21.34 
 
 
394 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3458  peptidase  23.46 
 
 
491 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0322  PepSY-associated TM helix  19.57 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2702  peptidase  24.07 
 
 
487 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5165  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase:oxidoreductase FAD-binding region  29.41 
 
 
736 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.974018  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4367  PepSY-associated TM helix domain protein  25.32 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0495183  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 
1117 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3290  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  25.18 
 
 
735 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126941  normal  0.108188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  23.12 
 
 
407 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0303  PepSY-associated TM helix  22.85 
 
 
470 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.190066  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1730  PepSY-associated TM helix domain protein  21.63 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0908  putative integral membrane protein  30.53 
 
 
504 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.843799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>