93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2126 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2126  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0869  rod shape-determining protein MreC  80.33 
 
 		 251 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0318  rod shape-determining protein MreC  58.55 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.462848  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1351  rod shape-determining protein MreC  54.04 
 
 		 248 aa  254  6e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.457737  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1396  rod shape-determining protein MreC  47.03 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0326  rod shape-determining protein MreC  45.11 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0336673  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0304  rod shape-determining protein MreC  45.65 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1693  rod shape-determining protein MreC  45.11 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0188  rod shape-determining protein MreC  48.24 
 
 		 248 aa  209  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0250391  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1466  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.68 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 348 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 		 358 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 359 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 		 448 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  23.25 
 
 		 329 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  23.25 
 
 		 330 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  24.78 
 
 		 334 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 		 367 aa  48.9  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 346 aa  48.9  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  23.81 
 
 		 285 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 		 333 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 285 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 338 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  24.87 
 
 		 357 aa  48.1  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  25.66 
 
 		 353 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  25.66 
 
 		 353 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  24.51 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  23.42 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 355 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  25.66 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  26.17 
 
 		 369 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  24.78 
 
 		 355 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  48.84 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 356 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 356 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 		 306 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 338 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 336 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  23.71 
 
 		 271 aa  45.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 336 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 336 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  32.39 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  26.37 
 
 		 315 aa  45.4  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 		 326 aa  45.4  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  24.54 
 
 		 274 aa  45.1  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  24.29 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  33.85 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 		 359 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  42 
 
 		 311 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  22.44 
 
 		 263 aa  42.7  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 		 291 aa  42.7  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.91 
 
 		 326 aa  42.4  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  25.6 
 
 		 357 aa  42.7  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 356 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  24.2 
 
 		 325 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 298 aa  42.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  24.2 
 
 		 333 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 302 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  24.2 
 
 		 330 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  35.53 
 
 		 267 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  24.22 
 
 		 286 aa  42  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  24.2 
 
 		 332 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  35.85 
 
 		 276 aa  42  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>