More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1586 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1586  lipoprotein  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1663  peptidyl-tRNA hydrolase  75.32 
 
 		 181 aa  247  6e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0337  peptidyl-tRNA hydrolase  67.52 
 
 		 181 aa  204  3e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1303  peptidyl-tRNA hydrolase  68.35 
 
 		 220 aa  193  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1364  peptidyl-tRNA hydrolase  58.06 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0334  peptidyl-tRNA hydrolase  56.69 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0357  peptidyl-tRNA hydrolase  56.69 
 
 		 181 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1653  peptidyl-tRNA hydrolase  56.69 
 
 		 181 aa  174  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00866088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0212  peptidyl-tRNA hydrolase  48.77 
 
 		 191 aa  143  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.145584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0466  peptidyl-tRNA hydrolase  47.24 
 
 		 184 aa  133  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.916816  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  40.99 
 
 		 195 aa  120  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  42.14 
 
 		 188 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  40.88 
 
 		 197 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  42.59 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.853012  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  42.14 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  42.18 
 
 		 199 aa  111  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2158  peptidyl-tRNA hydrolase  53.77 
 
 		 239 aa  111  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0489  peptidyl-tRNA hydrolase  47.79 
 
 		 202 aa  111  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3581  peptidyl-tRNA hydrolase  45.26 
 
 		 198 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1264  peptidyl-tRNA hydrolase  45.9 
 
 		 235 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  47.58 
 
 		 213 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  38.6 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0656  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 		 199 aa  108  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5435  peptidyl-tRNA hydrolase  38.36 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3227  peptidyl-tRNA hydrolase  39.16 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.783936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0947  peptidyl-tRNA hydrolase  36.81 
 
 		 235 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  45.97 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  37.5 
 
 		 213 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0949  peptidyl-tRNA hydrolase  41.27 
 
 		 216 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  42.98 
 
 		 188 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0897  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 230 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3612  peptidyl-tRNA hydrolase  37.01 
 
 		 213 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2393  peptidyl-tRNA hydrolase  40.58 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2818  peptidyl-tRNA hydrolase  40.88 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0122203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  42.64 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1632  peptidyl-tRNA hydrolase  43.62 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924241 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1291  peptidyl-tRNA hydrolase  41.43 
 
 		 204 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  44.19 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 202 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 202 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  41.88 
 
 		 184 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1662  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 		 225 aa  103  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.107221  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0175  peptidyl-tRNA hydrolase  54.08 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.967698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1099  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.745166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0637  peptidyl-tRNA hydrolase  41.56 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.205248  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0770  peptidyl-tRNA hydrolase  48.78 
 
 		 205 aa  102  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0893  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.741302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0822  peptidyl-tRNA hydrolase  39.06 
 
 		 211 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.750534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0676  peptidyl-tRNA hydrolase  39.38 
 
 		 213 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1086  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3500  peptidyl-tRNA hydrolase  41.8 
 
 		 213 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000021188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  43.75 
 
 		 201 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0824  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 225 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2402  peptidyl-tRNA hydrolase  43.65 
 
 		 210 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.919622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0394  peptidyl-tRNA hydrolase  37.89 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000248474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2483  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 225 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.697792  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0352  peptidyl-tRNA hydrolase  44.17 
 
 		 225 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4347  peptidyl-tRNA hydrolase  36.36 
 
 		 210 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0270  peptidyl-tRNA hydrolase  38.67 
 
 		 185 aa  100  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 210 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4125  peptidyl-tRNA hydrolase  40.15 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2474  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 210 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2697  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 		 210 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  41.1 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  43.17 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  44.26 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  36.6 
 
 		 186 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1675  peptidyl-tRNA hydrolase  39.6 
 
 		 192 aa  99.8  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.224876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1560  peptidyl-tRNA hydrolase  46.23 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0200988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  40.77 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2116  peptidyl-tRNA hydrolase  41.18 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  40.91 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1172  peptidyl-tRNA hydrolase  45 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00235616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  32.45 
 
 		 190 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  32.45 
 
 		 190 aa  98.6  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2256  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.12 
 
 		 205 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.281218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0516  peptidyl-tRNA hydrolase  36.84 
 
 		 193 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2606  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 		 202 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.642317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  39.86 
 
 		 186 aa  98.2  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1170  peptidyl-tRNA hydrolase  43.65 
 
 		 194 aa  97.8  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  36.24 
 
 		 190 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1618  peptidyl-tRNA hydrolase  42.22 
 
 		 189 aa  97.4  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  39.86 
 
 		 209 aa  97.1  9e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  40 
 
 		 186 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4839  peptidyl-tRNA hydrolase  37.34 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881086  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  38.3 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  41.22 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0183  peptidyl-tRNA hydrolase  38.78 
 
 		 193 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.19 
 
 		 206 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1454  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.04 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00118085  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0170  peptidyl-tRNA hydrolase  39.46 
 
 		 193 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  39.53 
 
 		 187 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  40.15 
 
 		 219 aa  96.3  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.84 
 
 		 183 aa  94.7  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  35.15 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  37.01 
 
 		 207 aa  94.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  48.08 
 
 		 189 aa  94.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1502  peptidyl-tRNA hydrolase  35.95 
 
 		 365 aa  94  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>