More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09378 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  100 
 
 		 540 aa  1117    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  52.22 
 
 		 544 aa  592  1e-168  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  49.52 
 
 		 543 aa  562  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  43.12 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  41.27 
 
 		 565 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  40.55 
 
 		 548 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  41.97 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  38.91 
 
 		 560 aa  363  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  40.18 
 
 		 553 aa  359  7e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  42.23 
 
 		 556 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  39.39 
 
 		 557 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  37.82 
 
 		 550 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  39.19 
 
 		 552 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  41.41 
 
 		 619 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  34.8 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  36.79 
 
 		 565 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  37.61 
 
 		 568 aa  297  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  37.65 
 
 		 554 aa  290  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  34.48 
 
 		 556 aa  287  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  33.84 
 
 		 536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.83 
 
 		 532 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  33.78 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  35.14 
 
 		 563 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  34.34 
 
 		 536 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.58 
 
 		 556 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  32.42 
 
 		 583 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.33 
 
 		 530 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  34.47 
 
 		 532 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  32.22 
 
 		 539 aa  254  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 526 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  32.27 
 
 		 527 aa  237  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.44 
 
 		 522 aa  233  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 533 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 532 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  34.02 
 
 		 589 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  28.49 
 
 		 543 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.5 
 
 		 574 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 543 aa  216  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 541 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  31.17 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  29.49 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  29.49 
 
 		 522 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  29.49 
 
 		 522 aa  209  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  30.27 
 
 		 557 aa  209  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  29.49 
 
 		 522 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  30.91 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.92 
 
 		 522 aa  207  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.76 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 520 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  29.19 
 
 		 522 aa  203  7e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.73 
 
 		 522 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.6 
 
 		 549 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  28.36 
 
 		 522 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.04 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 545 aa  199  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 520 aa  199  7.999999999999999e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  27.84 
 
 		 522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.88 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.8 
 
 		 547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  29.08 
 
 		 563 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  27.34 
 
 		 569 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.97 
 
 		 538 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.54 
 
 		 535 aa  183  7e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 582 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  28.8 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 542 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  27.86 
 
 		 564 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  27.85 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.84 
 
 		 537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  26.51 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.15 
 
 		 543 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  26.75 
 
 		 584 aa  174  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 537 aa  174  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 540 aa  173  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 537 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  28.46 
 
 		 530 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.67 
 
 		 544 aa  172  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 555 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  28.23 
 
 		 585 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.04 
 
 		 527 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  28.7 
 
 		 576 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.1 
 
 		 564 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  29.19 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.16 
 
 		 601 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.37 
 
 		 564 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  26.7 
 
 		 549 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 548 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 548 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 548 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.07 
 
 		 562 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.83 
 
 		 548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  27.97 
 
 		 587 aa  163  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.44 
 
 		 548 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>