106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05280 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05280  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06295  short chain dehydrogenase  62.12 
 
 		 200 aa  267  5.9999999999999995e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4312  short chain dehydrogenase  44.44 
 
 		 199 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1238  short chain dehydrogenase  45.45 
 
 		 199 aa  188  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50610  short chain dehydrogenase  43.94 
 
 		 223 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0391945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5629  short chain dehydrogenase  45.18 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0313  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0297  short chain dehydrogenase  43.59 
 
 		 199 aa  177  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0657  short chain dehydrogenase  43.15 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.769936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1664  short chain dehydrogenase  38.27 
 
 		 199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2493  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3670  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3138  short chain dehydrogenase  37.88 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl362  short chain dehydrogenase  41.79 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  3.68833e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3793  short chain dehydrogenase  41.92 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1726  short chain dehydrogenase  41.33 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4284  short chain dehydrogenase  36.55 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.206363 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0613  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0886445 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4883  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4448  short chain dehydrogenase  36.04 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3331  short chain dehydrogenase  40 
 
 		 201 aa  154  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0789  short chain dehydrogenase  40.91 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5475  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5387  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2512  short chain dehydrogenase  36.73 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296656  normal  0.253878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1736  short chain dehydrogenase  40.51 
 
 		 201 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.157452 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1873  short chain dehydrogenase  39.49 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4306  short chain dehydrogenase  38.69 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3526  short chain dehydrogenase  40.35 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0150103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2520  short chain dehydrogenase  39.8 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0216463  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0927  short chain dehydrogenase  35.53 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.115438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3200  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2619  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3613  short chain dehydrogenase  43.4 
 
 		 199 aa  140  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6188  short chain dehydrogenase  45.06 
 
 		 198 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1778  short chain dehydrogenase  37.76 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0802  short chain dehydrogenase  28.49 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2324  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 245 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06495  oxidoreductase  31.1 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.66 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.87 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2533  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.41 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3870  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0938  Short-chain alcohol dehydrogenase  25.97 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.78 
 
 		 274 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5752  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.14 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.213287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.29 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 259 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.429144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.21 
 
 		 248 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11298  short chain dehydrogenase  22.56 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 		 239 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0910719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.48 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.2 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.84 
 
 		 293 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.133433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 256 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3071  short chain dehydrogenase  25 
 
 		 264 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.44 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.01 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.37 
 
 		 293 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 260 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.04 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.28 
 
 		 295 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  23.6 
 
 		 317 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.28 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0819  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.24 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0822  short chain dehydrogenase  24.55 
 
 		 262 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00305292  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2917  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.66 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5249  short chain dehydrogenase  24.02 
 
 		 318 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.109132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.55 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  24.44 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  26.24 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  24.24 
 
 		 339 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.138862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.08 
 
 		 260 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  26.24 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.41 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  26.24 
 
 		 257 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.43 
 
 		 255 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.11 
 
 		 291 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60014  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3131  short chain dehydrogenase  31.61 
 
 		 250 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351639  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  22.31 
 
 		 247 aa  42.4  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.22 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.22 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.73 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0994645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  23.94 
 
 		 252 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 		 245 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2783  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.19 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.38 
 
 		 263 aa  42  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.98 
 
 		 253 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3326  short chain dehydrogenase  29.68 
 
 		 246 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.53 
 
 		 334 aa  41.6  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  25.6 
 
 		 246 aa  41.6  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.01 
 
 		 243 aa  41.6  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.49 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0706  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  24.76 
 
 		 474 aa  41.6  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.266926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>