More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0923 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0923  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.191256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3020  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.58 
 
 
252 aa  256  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.103578 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0994  enoyl-CoA hydratase  49.8 
 
 
273 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.26 
 
 
250 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103858  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1561  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.8 
 
 
258 aa  245  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2492  enoyl-CoA hydratase  51.42 
 
 
256 aa  244  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2366  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
289 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000255309  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1886  enoyl-CoA hydratase  48.39 
 
 
268 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0955697  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5093  enoyl-CoA hydratase  49 
 
 
263 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.382387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7093  enoyl-CoA hydratase  47.79 
 
 
267 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0658855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1988  enoyl-CoA hydratase  47.93 
 
 
268 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138891  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0605  enoyl-CoA hydratase  48.73 
 
 
260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3578  enoyl-CoA hydratase  47.11 
 
 
268 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0354874  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6456  enoyl-CoA hydratase  47.97 
 
 
261 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3111  enoyl-CoA hydratase  47.08 
 
 
264 aa  221  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.554974  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4402  enoyl-CoA hydratase  44.05 
 
 
257 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0274  enoyl-CoA hydratase  44.92 
 
 
260 aa  201  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00265078  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2560  enoyl-CoA hydratase  41.96 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4798  enoyl-CoA hydratase  42.69 
 
 
265 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5283  enoyl-CoA hydratase  43.14 
 
 
263 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  30.4 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.13 
 
 
651 aa  132  7.999999999999999e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.16 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  31.2 
 
 
659 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1034  short chain enoyl-CoA hydratase  33.6 
 
 
256 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0524652  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3584  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  126  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  31.09 
 
 
662 aa  125  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.74 
 
 
260 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.47 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2951  short chain enoyl-CoA hydratase  37.01 
 
 
257 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.08 
 
 
260 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  28.84 
 
 
662 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1353  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.63 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0413537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  31.82 
 
 
260 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  31.2 
 
 
663 aa  118  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  32.89 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  32.26 
 
 
662 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  32.66 
 
 
257 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.63 
 
 
261 aa  115  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4211  short chain enoyl-CoA hydratase  32.18 
 
 
258 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3571  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.56 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.751263  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.25 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  34.9 
 
 
661 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.2 
 
 
261 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.56 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5303  enoyl-CoA hydratase  33.62 
 
 
264 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  31.65 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
270 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  31.23 
 
 
258 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1595  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.48 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  30.31 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  31.98 
 
 
280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  32 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.92 
 
 
266 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1713  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.64 
 
 
252 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 
253 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.18 
 
 
264 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.73 
 
 
259 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.95 
 
 
258 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0941  enoyl-CoA hydratase  35.2 
 
 
257 aa  109  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0005  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.35 
 
 
260 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.77 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3938  short chain enoyl-CoA hydratase  38.07 
 
 
254 aa  108  7.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0828  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.71 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.46 
 
 
258 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.415627  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.77 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.77 
 
 
255 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.2 
 
 
258 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174698  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  32.74 
 
 
257 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
257 aa  108  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1450  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.6 
 
 
256 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1122  short chain enoyl-CoA hydratase  29.57 
 
 
262 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.29 
 
 
268 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
257 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4172  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.09 
 
 
258 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2627  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
257 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000218794  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1340  short chain enoyl-CoA hydratase  31.58 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.58 
 
 
258 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.63 
 
 
260 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 
280 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  32.34 
 
 
255 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3369  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.96 
 
 
262 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186723  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  31.98 
 
 
270 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  31.42 
 
 
270 aa  106  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1762  short chain enoyl-CoA hydratase  33.2 
 
 
267 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0266496  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.9 
 
 
261 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2899  enoyl-CoA hydratase  31.17 
 
 
258 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0239  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.08 
 
 
258 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0936  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.17 
 
 
260 aa  105  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1545  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.4 
 
 
258 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6304  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.54 
 
 
259 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
291 aa  105  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.91 
 
 
264 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
270 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  29.17 
 
 
260 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  29.49 
 
 
270 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.95 
 
 
264 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>