More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2521 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2521  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0949356 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  62.38 
 
 		 218 aa  267  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  61.9 
 
 		 216 aa  263  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  262  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  262  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  260  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  60.48 
 
 		 212 aa  260  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  61.24 
 
 		 212 aa  259  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  257  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  60.48 
 
 		 212 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  58.57 
 
 		 212 aa  256  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  60.48 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  62.25 
 
 		 215 aa  255  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 216 aa  255  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.62 
 
 		 215 aa  254  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  60.95 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.24 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  57.62 
 
 		 212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  58.57 
 
 		 216 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  55.71 
 
 		 215 aa  251  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  55.71 
 
 		 215 aa  251  7e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  58.77 
 
 		 217 aa  251  7e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 216 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  57.62 
 
 		 215 aa  251  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 216 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 215 aa  248  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  57.62 
 
 		 216 aa  248  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 214 aa  246  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 		 214 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  56.4 
 
 		 217 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  56.87 
 
 		 217 aa  245  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  58.1 
 
 		 215 aa  244  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  59.05 
 
 		 212 aa  244  8e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 216 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.14 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.14 
 
 		 215 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 214 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 214 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  57.62 
 
 		 212 aa  242  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  55.24 
 
 		 216 aa  242  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.62 
 
 		 213 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  54.98 
 
 		 217 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  56.67 
 
 		 213 aa  241  5e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  57.14 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  59.52 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  56.67 
 
 		 214 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  57.62 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  52.38 
 
 		 216 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  52.38 
 
 		 216 aa  238  4e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.24 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  54.76 
 
 		 215 aa  237  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  55.24 
 
 		 214 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  55.02 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.81 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  52.38 
 
 		 216 aa  232  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2731  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  54.76 
 
 		 212 aa  230  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.413417  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.86 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.86 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  53 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  51.74 
 
 		 201 aa  211  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0396  isopropylmalate isomerase small subunit  51.74 
 
 		 201 aa  210  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  51 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4656  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.28 
 
 		 200 aa  208  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4547  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.258236  normal  0.011903 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4233  isopropylmalate isomerase small subunit  48.26 
 
 		 201 aa  201  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  51.74 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0078  isopropylmalate isomerase small subunit  50.99 
 
 		 201 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00073  isopropylmalate isomerase small subunit  50.99 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3527  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.99 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0074  isopropylmalate isomerase small subunit  50.99 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0065  isopropylmalate isomerase small subunit  50.99 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0742  isopropylmalate isomerase small subunit  50.74 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.843634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3586  isopropylmalate isomerase small subunit  50.99 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0337  isopropylmalate isomerase small subunit  49.25 
 
 		 201 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.999258  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0389  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00072  hypothetical protein  50.99 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0400  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000488217 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3538  isopropylmalate isomerase small subunit  50.24 
 
 		 200 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0388  isopropylmalate isomerase small subunit  49 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>