More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4656 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4656  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  62.12 
 
 
218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  57.5 
 
 
215 aa  249  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.6 
 
 
215 aa  248  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  60.5 
 
 
212 aa  245  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  58.29 
 
 
212 aa  245  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  58.08 
 
 
212 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  58.5 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  58.08 
 
 
216 aa  242  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4274  isopropylmalate isomerase small subunit  58.67 
 
 
212 aa  242  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123411  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  58.29 
 
 
212 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.29 
 
 
240 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  60.41 
 
 
216 aa  240  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  60.41 
 
 
216 aa  240  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  58 
 
 
215 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
212 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  58 
 
 
215 aa  239  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  57 
 
 
215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  238  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  59.39 
 
 
215 aa  238  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  58.79 
 
 
216 aa  237  6.999999999999999e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  57.36 
 
 
216 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  58.88 
 
 
217 aa  237  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1984  isopropylmalate isomerase small subunit  57.07 
 
 
213 aa  237  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.238956  normal  0.0387343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  60 
 
 
216 aa  236  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  58.29 
 
 
216 aa  236  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  59.39 
 
 
216 aa  235  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  58.29 
 
 
212 aa  235  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  57.79 
 
 
214 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  56.57 
 
 
214 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  56.57 
 
 
214 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
216 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
216 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
216 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
216 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
216 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
216 aa  234  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
216 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  59.09 
 
 
217 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.57 
 
 
216 aa  234  9e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  56.06 
 
 
214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  57.87 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  56.35 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  57.36 
 
 
216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.57 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  58.38 
 
 
216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  57.36 
 
 
216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  57.36 
 
 
216 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57.07 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  56.06 
 
 
214 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  58.59 
 
 
217 aa  232  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  57.58 
 
 
217 aa  231  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  55.56 
 
 
214 aa  231  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1382  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  57 
 
 
215 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  0.419844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.57 
 
 
212 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  60.1 
 
 
217 aa  230  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  55.84 
 
 
215 aa  230  9e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  55.05 
 
 
214 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0863  isopropylmalate isomerase small subunit  54.55 
 
 
212 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000359889  hitchhiker  0.000927879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.92 
 
 
216 aa  229  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  56.5 
 
 
215 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2473  isopropylmalate isomerase small subunit  55.84 
 
 
216 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0929979  normal  0.412419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  55.78 
 
 
215 aa  228  4e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  57.36 
 
 
216 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  57.44 
 
 
216 aa  227  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  55.56 
 
 
214 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  55.28 
 
 
215 aa  224  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  56.85 
 
 
216 aa  223  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  53.54 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2731  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.76 
 
 
212 aa  215  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.413417  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  54.4 
 
 
207 aa  209  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2521  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  52.28 
 
 
210 aa  208  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0949356 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  50.76 
 
 
216 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  49.48 
 
 
201 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  51.53 
 
 
201 aa  207  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  52.04 
 
 
201 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  50.26 
 
 
202 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0776  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0626  isopropylmalate isomerase small subunit  49.49 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.74 
 
 
201 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 
201 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
202 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  49.74 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  49.22 
 
 
201 aa  197  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  49.22 
 
 
211 aa  197  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  48.96 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.47 
 
 
204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  48.96 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.45 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3817  isopropylmalate isomerase small subunit  52.17 
 
 
201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  51.04 
 
 
200 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  48.7 
 
 
209 aa  194  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  48.44 
 
 
201 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  47.96 
 
 
201 aa  193  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>