More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2080 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 378 aa  775    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  92.51 
 
 		 393 aa  695    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  83.52 
 
 		 365 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1107  ABC transporter related  63.48 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0772086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4324  ABC transporter-related protein  61.5 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.935984 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1725  ABC transporter related  54.87 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146512  normal  0.897098 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6354  ABC transporter related  55.99 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2334  ABC transporter related  53.76 
 
 		 363 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3457  ABC transporter related  52.81 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2095  ABC transporter related  53.52 
 
 		 368 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.85 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9197  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  55.15 
 
 		 359 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4571  ABC transporter related  55.03 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0885  ABC transporter related  48.47 
 
 		 357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.388134 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  49.3 
 
 		 356 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  48.88 
 
 		 356 aa  347  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  48.88 
 
 		 365 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3407  ABC transporter related  47.4 
 
 		 368 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  48.74 
 
 		 355 aa  333  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  46.17 
 
 		 369 aa  332  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  46.88 
 
 		 371 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1295  glucose ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 		 386 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1116  ABC transporter:TOBE  45.23 
 
 		 389 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110421  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  46.61 
 
 		 371 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  46.32 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23010  putative ATP-binding component of ABC transporter  46.58 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0424351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4206  ABC transporter related  45.75 
 
 		 384 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  47.53 
 
 		 355 aa  325  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  46.63 
 
 		 355 aa  325  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  48.09 
 
 		 368 aa  324  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  47.18 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1153  ABC transporter related  45.88 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203038  normal  0.427796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1018  sugar ABC transporter, ATP-binding subunit  46.05 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1056  ABC transporter related  46.05 
 
 		 384 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0095  ABC transporter component  48.01 
 
 		 372 aa  323  3e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0263152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  48.74 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  46.43 
 
 		 363 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 		 363 aa  322  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1381  ABC transporter related  45.8 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3488  ABC transporter related  45.8 
 
 		 371 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  47.65 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1942  ABC transporter ATP-binding protein  46.01 
 
 		 386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  46.93 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  49.04 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  48.09 
 
 		 365 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  48.34 
 
 		 354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  46.69 
 
 		 354 aa  318  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1016  ABC transporter related  44.93 
 
 		 384 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2637  ABC transporter-like  47.37 
 
 		 372 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  48.84 
 
 		 355 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  47.62 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  48.62 
 
 		 357 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  48.91 
 
 		 363 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  47.34 
 
 		 351 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1702  ABC transporter related  48.48 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5741  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  48.61 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.33 
 
 		 363 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45.68 
 
 		 353 aa  317  3e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3398  ABC transporter related  48.01 
 
 		 357 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.129757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.78 
 
 		 369 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3932  ABC transporter related  46.03 
 
 		 371 aa  315  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3448  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.18 
 
 		 371 aa  315  9e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3126  ABC transporter related  48 
 
 		 359 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1031  ABC transporter related  47.18 
 
 		 371 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.865528  normal  0.0793172 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5678  ABC transporter related  49.72 
 
 		 365 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209131  normal  0.1873 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  47.63 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3167  ABC transporter related  44.05 
 
 		 370 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3693  ABC transporter related  47.25 
 
 		 357 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0800  ABC transporter related  48.34 
 
 		 357 aa  313  1.9999999999999998e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.885684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  47.63 
 
 		 356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  48.18 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  47.5 
 
 		 367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2649  ABC transporter related  45.68 
 
 		 381 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  47.19 
 
 		 352 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  47.63 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  49.18 
 
 		 360 aa  312  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  46.65 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  49.18 
 
 		 360 aa  312  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  47.79 
 
 		 360 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  46.35 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  47.93 
 
 		 360 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  47.65 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  47.62 
 
 		 357 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  48.08 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  44.69 
 
 		 354 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.94 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0631  ABC transporter related  46.46 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  46.35 
 
 		 357 aa  311  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  46.54 
 
 		 360 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  49.18 
 
 		 362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  46.02 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  48.2 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  46.02 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2413  ABC transporter related  59.34 
 
 		 376 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  46.02 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0955  ABC transporter related  47.21 
 
 		 365 aa  309  4e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  44.78 
 
 		 372 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.46 
 
 		 350 aa  308  9e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  45.72 
 
 		 364 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>