More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0682 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  100 
 
 
286 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  90.11 
 
 
283 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  74.38 
 
 
283 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  66.9 
 
 
283 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  68.09 
 
 
284 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 
283 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 
283 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 
283 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 
283 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  67.62 
 
 
283 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  64.95 
 
 
293 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  58.21 
 
 
285 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  57.56 
 
 
307 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  59.77 
 
 
260 aa  326  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  42.7 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  42.91 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
394 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
267 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  28.57 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  33.9 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  25 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  22.22 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.22 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.2 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  24.51 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.22 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  26.24 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  21.85 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  31.78 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  35.16 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  32.14 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.09 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  21.85 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  24.18 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  31.19 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  26.79 
 
 
219 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  24.05 
 
 
263 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  31.19 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.05 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.81 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  21.85 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  25.54 
 
 
270 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
380 aa  63.5  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  26.91 
 
 
269 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  24.36 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  30.56 
 
 
296 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
355 aa  62.4  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
272 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
275 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
264 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
273 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  22.91 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.62 
 
 
370 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
278 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  26.36 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  23.27 
 
 
279 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  34.29 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  27.59 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0700  alpha/beta fold family hydrolase  22.61 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.338828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  28.69 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  21.45 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  28.95 
 
 
293 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0011  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
351 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.4 
 
 
372 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
368 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 
335 aa  59.7  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
368 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 
368 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
366 aa  59.3  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 
278 aa  59.3  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>