More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0600 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0600  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 
285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0871722 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5146  extracellular solute-binding protein  95.44 
 
 
285 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36869  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6504  ABC transporter substrate-binding protein  31.91 
 
 
296 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5150  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109685  normal  0.942381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0293  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0936  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  33.04 
 
 
313 aa  112  9e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.019687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  28.88 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3683  extracellular solute-binding protein family 3  27.17 
 
 
301 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3383  extracellular solute-binding protein family 3  34.16 
 
 
320 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0404441  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1641  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
302 aa  88.2  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256735  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  30.13 
 
 
323 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  29.44 
 
 
294 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 
280 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0937  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  28.75 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.122592  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4320  extracellular solute-binding protein family 3  29.28 
 
 
337 aa  82.4  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
266 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
280 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1068  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 
302 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.343066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  25.96 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0358  cystine transporter subunit  25.74 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.95727 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  27.57 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0388  extracellular solute-binding protein family 3  33.33 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.312775  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2363  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.19 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4595  amino acid ABC transporter  27.05 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0391985 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1924  glutamine-binding periplasmic protein/glutamine transport system permease protein  27.31 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.07 
 
 
264 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1330  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.94 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0041  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.347701  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  27.44 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1478  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.41 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0533166  normal  0.855747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  27.07 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  25.37 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  27.07 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.23 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  25.37 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5447  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.111655  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  27.24 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  27.07 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  25.37 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.44 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2377  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.89 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4610  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.232439  hitchhiker  0.000666922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.18 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.75 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2380  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.86 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  28.33 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2239  flagellar hook protein FlgE  24.63 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000435982  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5241  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.421239  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5618  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
267 aa  72  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138566  normal  0.0848132 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.18 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0869  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4897  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
267 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.569673 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0886  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1379  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.18 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539122  normal  0.578964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2189  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000000925831  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0875  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  26.81 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1501  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2658  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.22 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1316  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.69 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2923  histidine kinase  26.99 
 
 
598 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0517  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  27.66 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.66 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2855  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0073  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.38 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1044  extracellular solute-binding protein family 3  24.6 
 
 
247 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  24.19 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  26.4 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>