More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0178 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 296 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  91.55 
 
 		 296 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4236  alpha/beta hydrolase fold protein  70.83 
 
 		 301 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  73.98 
 
 		 301 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2497  alpha/beta fold family hydrolase  66.11 
 
 		 301 aa  361  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  64.33 
 
 		 303 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  64 
 
 		 303 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  65.77 
 
 		 301 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1333  alpha/beta fold family hydrolase  65.44 
 
 		 301 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0975  alpha/beta fold family hydrolase  65.44 
 
 		 301 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0592  alpha/beta fold family hydrolase  65.44 
 
 		 301 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0316  alpha/beta fold family hydrolase  65.44 
 
 		 301 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271899  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1310  alpha/beta fold family hydrolase  65 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0918705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1108  Alpha/beta hydrolase  65.76 
 
 		 298 aa  346  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024849  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3987  alpha/beta hydrolase fold  63.73 
 
 		 298 aa  345  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136743  normal  0.0524037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5594  alpha/beta hydrolase fold  65.98 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106478 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3661  alpha/beta hydrolase fold  65.98 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4706  alpha/beta hydrolase fold  65.98 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.456588  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3170  alpha/beta hydrolase fold protein  49.63 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.702233  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3568  Alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0257229  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0950  alpha/beta hydrolase fold  43.8 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3690  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.557915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4507  alpha/beta hydrolase fold  45 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.412971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4639  alpha/beta hydrolase fold protein  45 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3960  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0820  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.274011  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0139  alpha/beta hydrolase  41.74 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  29.77 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  24.81 
 
 		 571 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 277 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  31.75 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  34.76 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  28.17 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  32.47 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  28.02 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  32.23 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.62 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.23 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  24.51 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.41 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.32 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 288 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  27.57 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  28.68 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  25.1 
 
 		 283 aa  72.4  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 		 393 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.02 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  23.48 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3049  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.652408  normal  0.351837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  36.7 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  29.77 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.37 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  42 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.48 
 
 		 562 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  42.73 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  29.34 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  36.84 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>