More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3601 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3601  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0450403  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5540  putative acetyl-CoA C-acyltransferase  70.44 
 
 
364 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3931  hypothetical protein  33.86 
 
 
397 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  34.02 
 
 
388 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  34.62 
 
 
387 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  30.89 
 
 
387 aa  172  9e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.64 
 
 
392 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  35.29 
 
 
387 aa  171  3e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.02 
 
 
378 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  32.17 
 
 
386 aa  170  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4354  thiolase  35.88 
 
 
387 aa  169  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  32.87 
 
 
388 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  34.44 
 
 
388 aa  168  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  32.07 
 
 
390 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  32.01 
 
 
395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  31.59 
 
 
383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.59 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.25 
 
 
384 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  39.42 
 
 
390 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  31.99 
 
 
392 aa  162  9e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  33.81 
 
 
387 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.45 
 
 
378 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.25 
 
 
391 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  35.9 
 
 
386 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  32.43 
 
 
396 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  37.63 
 
 
394 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.3 
 
 
376 aa  157  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  32.34 
 
 
390 aa  157  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  30.37 
 
 
388 aa  155  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1472  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.73 
 
 
417 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.41 
 
 
392 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.41 
 
 
392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0113  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  40.47 
 
 
465 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  33.33 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0040  thiolase  33.42 
 
 
421 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  36.65 
 
 
388 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  31.41 
 
 
385 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  33.17 
 
 
383 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  31.82 
 
 
389 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4195  Thiolase  35.08 
 
 
390 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0815171  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  38.62 
 
 
403 aa  149  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3781  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000395838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  38.71 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  36.73 
 
 
390 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  31.31 
 
 
388 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  39.57 
 
 
383 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  38.71 
 
 
413 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  38.71 
 
 
413 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6395  thiolase  40.08 
 
 
413 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0582995  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4352  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  38.71 
 
 
413 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  35.39 
 
 
388 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  37.8 
 
 
402 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5101  Thiolase  31.16 
 
 
413 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.01 
 
 
385 aa  143  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2721  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33 
 
 
395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  37.8 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  36.99 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  36.18 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1006  Thiolase  33.06 
 
 
388 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.63654  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  35.8 
 
 
393 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  34.36 
 
 
390 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.05 
 
 
387 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0941  lipid-transfer protein  35.26 
 
 
398 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.303203  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  30.69 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  31.38 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  31.72 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  30.61 
 
 
388 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2744  thiolase  39.3 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569153  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  36.89 
 
 
386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  36.15 
 
 
388 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  31.66 
 
 
382 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  34.98 
 
 
384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.74 
 
 
397 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4205  thiolase  30.71 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0790  thiolase  34.65 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.94 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1814  thiolase  32.28 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4694  lipid-transfer protein  34.67 
 
 
406 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  37.55 
 
 
381 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  31.2 
 
 
404 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  35.66 
 
 
383 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  35.34 
 
 
386 aa  129  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  35.25 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  33.58 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  35.51 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.7 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  33.44 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  32.66 
 
 
395 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  31.1 
 
 
401 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0378  acetyl-CoA acetyltransferase  29.49 
 
 
392 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.855021  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  33.15 
 
 
388 aa  126  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.24 
 
 
381 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  34.36 
 
 
381 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  30.55 
 
 
380 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3625  lipid-transfer protein  36.8 
 
 
393 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.595778  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  30.55 
 
 
380 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  30.55 
 
 
380 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  33.33 
 
 
384 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.08 
 
 
381 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  29.72 
 
 
384 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.468644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>