154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4968 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  54.42 
 
 
205 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  50.54 
 
 
207 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  50 
 
 
245 aa  185  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  50 
 
 
242 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  50 
 
 
207 aa  184  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  55.15 
 
 
207 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  55.15 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  55.15 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  56.6 
 
 
223 aa  174  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  55.97 
 
 
223 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  55.97 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  55.97 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  55.97 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  55.97 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  55.97 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  55.97 
 
 
207 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  49.39 
 
 
183 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  48.1 
 
 
169 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  45.29 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  52.11 
 
 
186 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  42.94 
 
 
183 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  44.38 
 
 
176 aa  133  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  39.24 
 
 
193 aa  131  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  39.05 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  39.05 
 
 
213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  40.99 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1559  hypothetical protein  80.88 
 
 
101 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.443609  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.25 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  38.71 
 
 
184 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  36.49 
 
 
177 aa  102  3e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  38.92 
 
 
197 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  35.76 
 
 
758 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  33.96 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  37.41 
 
 
162 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  37.41 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  37.41 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  35.22 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  32.92 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  35.22 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  37.5 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  36.21 
 
 
188 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  35.47 
 
 
190 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  33.72 
 
 
404 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.36 
 
 
196 aa  86.3  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  31.54 
 
 
176 aa  85.1  7e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  30.86 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  29.14 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.65 
 
 
386 aa  78.2  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  32.88 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  28.78 
 
 
376 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  32.05 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.92 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  31.69 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.81 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  36.67 
 
 
363 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  28.78 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.28 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  27.72 
 
 
392 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  27.21 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  25.85 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  28.17 
 
 
151 aa  55.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  30.53 
 
 
397 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4695  nuclease-related protein  26.92 
 
 
206 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.353435 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  30.53 
 
 
397 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  29.63 
 
 
397 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.77 
 
 
397 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.77 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.77 
 
 
397 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  29.77 
 
 
397 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4073  phospholipase D/transphosphatidylase  31.29 
 
 
446 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.25105 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0127  phospholipase D/Transphosphatidylase  25.34 
 
 
484 aa  53.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.248626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  29.87 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1413  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.23 
 
 
395 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.77486e-20 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1178  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.99 
 
 
425 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.317837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2797  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.23 
 
 
395 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000114147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  28.11 
 
 
391 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3572  phospholipase D/transphosphatidylase  32.56 
 
 
180 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  29.77 
 
 
397 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  30.14 
 
 
481 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4242  cardiolipin synthetase 2  28.57 
 
 
502 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0213  phospholipase D/transphosphatidylase  30.82 
 
 
192 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.387625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3457  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.98 
 
 
392 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2510  phospholipase D/transphosphatidylase  31.4 
 
 
481 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  34.55 
 
 
487 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  27.54 
 
 
184 aa  48.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1906  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.73 
 
 
536 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.279209  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2290  phospholipase D/transphosphatidylase  28.24 
 
 
427 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  hitchhiker  0.000316655 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.33 
 
 
551 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  27.82 
 
 
397 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1953  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 
486 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.785263  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2156  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 
486 aa  47.4  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430698  normal  0.0562881 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2063  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 
486 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2292  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 
486 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0474  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.79 
 
 
483 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000276559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1991  cardiolipin synthetase  28.7 
 
 
486 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.27 
 
 
366 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  26.12 
 
 
389 aa  45.8  0.0005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.83 
 
 
476 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>