46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4962 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  1006    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  88.3 
 
 		 487 aa  898    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5579  Fis family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 376 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6537  Fis family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 380 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4770  hypothetical protein  27.58 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.189721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3693  hypothetical protein  32.03 
 
 		 299 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.713079  normal  0.792602 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6273  helix-turn-helix, Fis-type  29.79 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  28.28 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5221  transcriptional regulator, Fis family  29.27 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.766336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1557  transcriptional regulator, Fis family  29.27 
 
 		 395 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  31.43 
 
 		 287 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  29.3 
 
 		 288 aa  99.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  28.91 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  33.68 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  31.46 
 
 		 287 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  25.47 
 
 		 300 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  24.92 
 
 		 299 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  24.92 
 
 		 299 aa  83.2  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1599  hypothetical protein  26.49 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.920348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4349  phage integrase family protein  28.52 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  27.84 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2218  hypothetical protein  26.42 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2531  Phage integrase, N-terminal SAM-like  25.54 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5432  hypothetical protein  30.88 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  31.02 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  27 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  27.49 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  28.21 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  30.49 
 
 		 306 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  34.32 
 
 		 307 aa  53.9  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 326 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1668  hypothetical protein  27.12 
 
 		 294 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.54325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3710  hypothetical protein  24.58 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2403  hypothetical protein  25.15 
 
 		 267 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1655  hypothetical protein  26.69 
 
 		 294 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  23.59 
 
 		 316 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4062  hypothetical protein  23.81 
 
 		 299 aa  47.4  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00820855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  24.8 
 
 		 337 aa  47  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2096  DNA-binding prophage protein  26.89 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  25.97 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25 
 
 		 295 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  24.01 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0390  hypothetical protein  24.25 
 
 		 295 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.644255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  24.23 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  26.97 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.27 
 
 		 275 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>