More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3383 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3383  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0509603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2729  inner-membrane translocator  91.03 
 
 		 290 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  decreased coverage  0.00299657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0289  inner-membrane translocator  90 
 
 		 290 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0160  inner-membrane translocator  85.52 
 
 		 311 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1748  inner-membrane translocator  82.07 
 
 		 290 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  66.9 
 
 		 288 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  66.78 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  66.09 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5706  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  66.9 
 
 		 289 aa  361  9e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.956551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4007  inner-membrane translocator  62.02 
 
 		 287 aa  302  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2453  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 289 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2060  inner-membrane translocator  59.79 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2248  transmembrane ABC transporter protein  61.54 
 
 		 289 aa  285  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4781  putative branched-chain amino acid ABC transport system permease  61.97 
 
 		 288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0372095  normal  0.329091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1364  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5149  inner-membrane translocator  55.23 
 
 		 274 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.416573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3731  inner-membrane translocator  42.76 
 
 		 289 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0649  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.41 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3184  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 287 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.819999 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3476  inner-membrane translocator  43.11 
 
 		 287 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218874 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4218  inner-membrane translocator  44.17 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.745671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1178  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2271  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 289 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.921298  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4296  inner-membrane translocator  41.26 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5445  ABC transporter membrane spanning protein  39.51 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  37.81 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 287 aa  172  6.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  35 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 287 aa  168  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  35.36 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  37.77 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  36.17 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 288 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 290 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  36.14 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 288 aa  149  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1505  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1288  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  35.21 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 286 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  33.92 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  34.68 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  33 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.68 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  34.6 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3492  ABC transporter membrane spanning protein (urea/amide)  34.13 
 
 		 542 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290236  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  31.44 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  32.79 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  34.83 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 294 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2062  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 353 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.813813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.4 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 527 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  32.75 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4228  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.23 
 
 		 551 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0420008  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4606  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.45 
 
 		 558 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  33.21 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1954  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.65 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  34.6 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 288 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  34.6 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 320 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  34.6 
 
 		 286 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6434  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.263735  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.06 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 294 aa  132  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.71 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3046  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1794  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 293 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385321  hitchhiker  0.00053204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4207  inner-membrane translocator  35 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  32.06 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7685  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.43 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1020  inner-membrane translocator  32.67 
 
 		 548 aa  131  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3701  inner-membrane translocator  32.98 
 
 		 537 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.233438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>