More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7253 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7253  ferredoxin  100 
 
 		 334 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  36.39 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  35.41 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  35.41 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  33.23 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  36.21 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.89 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  33.89 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  33.11 
 
 		 322 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  35.22 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  32.72 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  34.47 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.54 
 
 		 315 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  35.55 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  34.16 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  33.85 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  33.85 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 321 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  33.44 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.54 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.85 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  30.46 
 
 		 320 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  34.06 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  33.12 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.19 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.64 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  33.77 
 
 		 316 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.82 
 
 		 321 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  34.1 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  34.27 
 
 		 775 aa  169  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  30.48 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  31.91 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  35.28 
 
 		 321 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  32.09 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  34.66 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  32.93 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5381  ferredoxin  36.22 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  33.44 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  34.31 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  33.85 
 
 		 324 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  31.48 
 
 		 319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  33.44 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  33.22 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  32.46 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  32.46 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  31.58 
 
 		 788 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  32.42 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  32.67 
 
 		 323 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.23 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  31.58 
 
 		 318 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  32.69 
 
 		 784 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  33.23 
 
 		 782 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  30.41 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.44 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.16 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  30.84 
 
 		 319 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  31.74 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  34.88 
 
 		 325 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  32.56 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  33.23 
 
 		 780 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  32 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1371  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.05 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.97 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  32 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  31.35 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  31.35 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  32.51 
 
 		 321 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.43 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  31.58 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  30.72 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  32.34 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  32.35 
 
 		 320 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  30.82 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  33.66 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  29.73 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  33.96 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  33.66 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  31.63 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  34.92 
 
 		 309 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  34.22 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  30.7 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  31.87 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  30.09 
 
 		 558 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  31.87 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  31.45 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  28.92 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1342  ferredoxin  33.03 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.605474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1139  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.23 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000137744 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  29.23 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  29.75 
 
 		 1070 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  33.13 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  31.67 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  32.27 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  32.88 
 
 		 788 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  32.51 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  32.03 
 
 		 794 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  31.25 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  32.79 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  32.2 
 
 		 318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>