120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7169 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7169  protein of unknown function DUF1214  100 
 
 		 456 aa  936    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3496  hypothetical protein  53.39 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5465  hypothetical protein  49.45 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3490  protein of unknown function DUF1254  38.06 
 
 		 452 aa  302  1e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1209  hypothetical protein  37.92 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.376745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3829  protein of unknown function DUF1254  28.31 
 
 		 445 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1253  hypothetical protein  30.15 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.881685  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2634  hypothetical protein  28.28 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.805074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4566  hypothetical protein  29.02 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.348758  normal  0.0184707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4247  hypothetical protein  26.64 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53241  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8195  protein of unknown function DUF1254  28.42 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0232  protein of unknown function DUF1254  26.88 
 
 		 436 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2480  protein of unknown function DUF1254  26.56 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0779635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6753  hypothetical protein  28.98 
 
 		 482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00687417 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3986  phosphatidylserine decarboxylase  28.12 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1293  hypothetical protein  26.28 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7485  protein of unknown function DUF1254  26.46 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4623  protein of unknown function DUF1254  28.24 
 
 		 482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.690064 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0350  hypothetical protein  27.79 
 
 		 465 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0215119  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0466  protein of unknown function DUF1254  27.95 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2471  hypothetical protein  29.5 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1832  hypothetical protein  26.65 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0322254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0741  protein of unknown function DUF1214  24.17 
 
 		 490 aa  110  7.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0382  hypothetical protein  25.82 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1063  hypothetical protein  25.45 
 
 		 493 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.294245  normal  0.0969669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0409  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390709  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0319  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6960  protein of unknown function DUF1254  27.3 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3454  hypothetical protein  29.1 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1847  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.418718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1757  hypothetical protein  25.96 
 
 		 432 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0851  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.437824  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1141  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2115  putative lipoprotein  25.96 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4882  hypothetical protein  26.29 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1208  hypothetical protein  26.55 
 
 		 484 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.614813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0423  hypothetical protein  27.66 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531053  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4218  hypothetical protein  34.27 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3898  hypothetical protein  28.43 
 
 		 442 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143262  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3704  hypothetical protein  27.06 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1716  hypothetical protein  26.3 
 
 		 462 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0458772  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1375  hypothetical protein  29.71 
 
 		 465 aa  97.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3390  protein of unknown function DUF1254  28.54 
 
 		 447 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3989  hypothetical protein  25.38 
 
 		 473 aa  96.3  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6666  protein of unknown function DUF1214  25.39 
 
 		 492 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.371166  normal  0.505876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2979  hypothetical protein  26.14 
 
 		 462 aa  93.6  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3919  hypothetical protein  28.65 
 
 		 438 aa  93.6  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.820039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1467  protein of unknown function DUF1254  27.23 
 
 		 471 aa  93.2  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00137026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0254  hypothetical protein  24.66 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.530486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3918  hypothetical protein  25.47 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5162  hypothetical protein  26.68 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0648745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3077  hypothetical protein  24.87 
 
 		 474 aa  90.5  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.923842  normal  0.428423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5000  hypothetical protein  30.86 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1113  protein of unknown function DUF1214  32.11 
 
 		 200 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.540526  normal  0.810485 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5150  protein of unknown function DUF1214  27.3 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  0.802645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3747  hypothetical protein  26.94 
 
 		 479 aa  87  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2605  protein of unknown function DUF1214  32.18 
 
 		 291 aa  86.7  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000461285  hitchhiker  0.000899244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3520  hypothetical protein  32.56 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4637  hypothetical protein  26.44 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2472  hypothetical protein  24.43 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3684  hypothetical protein  34.68 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0446196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3151  hypothetical protein  25.26 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00208087  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3213  hypothetical protein  25.26 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211255  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3163  hypothetical protein  24.19 
 
 		 479 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0165  hypothetical protein  25.56 
 
 		 478 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  0.139033 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5642  hypothetical protein  28.12 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0095  protein of unknown function DUF1254  23.45 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.870201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0102  protein of unknown function DUF1254  23.44 
 
 		 487 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.972928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3476  hypothetical protein  25.88 
 
 		 479 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0744  hypothetical protein  26.09 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.278709 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4317  hypothetical protein  25.34 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2936  putative lipoprotein  25 
 
 		 465 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3029  hypothetical protein  23.59 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633531 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3300  hypothetical protein  26.4 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064553 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6909  protein of unknown function DUF1254  29.81 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401132  normal  0.566125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5226  hypothetical protein  35.14 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.254071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3051  hypothetical protein  26.71 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  0.746733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5158  hypothetical protein  35.33 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1456  hypothetical protein  26.85 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5367  hypothetical protein  23.03 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5493  hypothetical protein  23.03 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0168482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5319  hypothetical protein  34.62 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1115  protein of unknown function DUF1214  35.61 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1631  hypothetical protein  23.9 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.619053  normal  0.145466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5372  hypothetical protein  24.04 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.920481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6891  protein of unknown function DUF1214  25 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0179873  normal  0.195601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2624  protein of unknown function DUF1214  32.08 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000350326  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4778  hypothetical protein  22.81 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4826  hypothetical protein  24.09 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.853525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6080  hypothetical protein  25.34 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.985101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2166  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.459318  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6665  protein of unknown function DUF1214  36.67 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110382  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1374  hypothetical protein  32.12 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1147  hypothetical protein  34.68 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.294682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6394  hypothetical protein  34.48 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3037  hypothetical protein  29.86 
 
 		 496 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.533722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04191  hypothetical protein  34.17 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2980  hypothetical protein  23.13 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.125715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0839  hypothetical protein  30.67 
 
 		 189 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04201  hypothetical protein  37.17 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>