More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6332 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  498  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  85.94 
 
 
249 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.42 
 
 
247 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0662  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.97 
 
 
249 aa  353  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493963  normal  0.469625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.54 
 
 
249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.69 
 
 
249 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.69 
 
 
249 aa  347  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.82 
 
 
249 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  77.82 
 
 
249 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.912648  hitchhiker  0.00281141 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0401  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  71.55 
 
 
259 aa  330  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0616963  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.39 
 
 
242 aa  325  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.85 
 
 
249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748494  normal  0.932613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.75 
 
 
249 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.51 
 
 
248 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.53 
 
 
247 aa  308  5.9999999999999995e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  58.85 
 
 
244 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.63 
 
 
247 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.54 
 
 
245 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.59 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.4 
 
 
245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.57 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
272 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
268 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
265 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
266 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
271 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  37.19 
 
 
277 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
267 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
317 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
268 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
282 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
268 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
267 aa  142  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  35.42 
 
 
274 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
338 aa  139  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2188  thiamine pyrophosphate protein central region  38.15 
 
 
847 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.941679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  41.86 
 
 
304 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.55 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
266 aa  135  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  44.25 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
287 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000201148  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1905  short chain dehydrogenase  32 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0945301  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  37.35 
 
 
275 aa  133  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  36.82 
 
 
344 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4067  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.36 
 
 
298 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.39 
 
 
280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
282 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 
284 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
279 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1073  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  36.4 
 
 
847 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1468  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.875416  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  39.66 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.47 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.51 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2827  short chain dehydrogenase  31.17 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  43.26 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2787  short chain dehydrogenase  32 
 
 
291 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  42.53 
 
 
286 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
272 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2942  short chain dehydrogenase  43.02 
 
 
280 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.976984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2507  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
307 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2506  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 
291 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
296 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  42.94 
 
 
276 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1733  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
286 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  38.4 
 
 
278 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2783  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
291 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0502462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2582  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 
291 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0166341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
307 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.07 
 
 
279 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3218  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 
268 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2806  short chain dehydrogenase  31.6 
 
 
291 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.928497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2590  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
291 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2541  short chain dehydrogenase  31.2 
 
 
291 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000142979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  41.53 
 
 
270 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
268 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.1 
 
 
279 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 
268 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2778  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
281 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143428  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.25 
 
 
276 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000224332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  42.05 
 
 
275 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  41.52 
 
 
268 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.81 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  45.4 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>