More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4356 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4356  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 283 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0682  alpha/beta family hydrolase  90.11 
 
 		 286 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.819683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6598  alpha/beta hydrolase fold protein  73.76 
 
 		 283 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  68.33 
 
 		 283 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  68.79 
 
 		 284 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 283 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  68.33 
 
 		 283 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 283 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  67.97 
 
 		 283 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  65.26 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1132  putative hydrolase  58.27 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5203  alpha/beta hydrolase fold protein  59.92 
 
 		 260 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.112668  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  57.68 
 
 		 307 aa  325  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2502  putative hydrolase  41.29 
 
 		 283 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28630  putative hydrolase  40.91 
 
 		 287 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2533  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 394 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  hitchhiker  0.000713201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1813  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557453  normal  0.0116174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 267 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03123  hydrolase protein  27.41 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  35.59 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.46 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.754545  normal  0.278795 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  22.14 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5136  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  24.37 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.07 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8516  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.2 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal  0.759464 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.41 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  21.56 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  22.74 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  22.74 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  27.68 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  26.84 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.97 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.74 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  22.74 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  34.17 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  30.97 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.95 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  25.1 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0368  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.324688 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  23.05 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  22.83 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  22.74 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  22.05 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0309  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  23.83 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4287  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  22.74 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.06 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  25.61 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  23.1 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  21.25 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 272 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  26.09 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  30.56 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.46 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2945  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.238938 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  30.56 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3801  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  30.56 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  24.73 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  20.8 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  18.39 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  34.29 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  25.97 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  26.44 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>