144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4257 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 		 333 aa  692    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  71.47 
 
 		 333 aa  514  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  70.27 
 
 		 333 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  40.53 
 
 		 343 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.64 
 
 		 363 aa  279  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.24 
 
 		 341 aa  278  9e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  43.95 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  39.71 
 
 		 353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  41.92 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  40.53 
 
 		 344 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  36.95 
 
 		 383 aa  252  5.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.19 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.28 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.06 
 
 		 345 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.11 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.75 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.65 
 
 		 320 aa  89.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 		 320 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.1 
 
 		 320 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.6 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.47 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.12 
 
 		 337 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.38 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.76 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.02 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0076  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321839 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0528  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.396522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  23.68 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.85 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7422  Luciferase-like monooxygenase  25.9 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2257  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  23.94 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0724  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.32 
 
 		 336 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584154 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1680  methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.49 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  26.48 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2214  glucose-6-phosphate dehydrogenase (coenzyme F420)  23.55 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2587  Luciferase-like monooxygenase  23.38 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0532  luciferase-like protein  23.48 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.080404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0544  luciferase family protein  23.48 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00841212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0522  luciferase family protein  23.48 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4404  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  22.44 
 
 		 338 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1520  Luciferase-like monooxygenase  26.56 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.784524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  27.84 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3238  luciferase family protein  28.72 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0148661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  23.57 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0341  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.65 
 
 		 326 aa  55.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.256412 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0922  luciferase family protein  24.43 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.188531  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  25.7 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.99 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10412  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd1  23.12 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1132  Luciferase-like monooxygenase  23.51 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  24.67 
 
 		 764 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.35 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  21.93 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 557 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0217  luciferase-like protein  21.75 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  26.63 
 
 		 507 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06300  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  25.52 
 
 		 299 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0211  luciferase family protein  22.8 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5511  luciferase family protein  25 
 
 		 380 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4431  coenzyme F420-dependent N(5),N(10)-methenyltetrahydromethanopterin  24.17 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  21.81 
 
 		 350 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  25.82 
 
 		 543 aa  52.8  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  27.83 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24550  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  23.68 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.604696 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1522  Luciferase-like monooxygenase  25.81 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0131104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4866  Luciferase-like monooxygenase  25.26 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00773357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  27.23 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3380  luciferase family protein  28.66 
 
 		 389 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556905  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 758 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  22.15 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0783  luciferase family protein  26.37 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0447629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0484  luciferase-like protein  24.54 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.573719  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0698  luciferase family protein  27.46 
 
 		 336 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281916  normal  0.0356984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  21.53 
 
 		 350 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  25.49 
 
 		 302 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3410  putative F420-dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  27.2 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6991  luciferase family protein  27.12 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  28.14 
 
 		 337 aa  49.7  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3375  luciferase family protein  25.39 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3088  luciferase-like protein  26.34 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1399  luciferase family protein  24.46 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00157589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2584  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000604781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02130  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.65 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 531 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3260  luciferase family protein  27.72 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  20.41 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2621  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  24.46 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 754 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3763  glucose-6-phosphate dehydrogenase, F420- dependent  21.34 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  24.25 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0564  luciferase family protein  30.26 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2003  Luciferase-like, subgroup  27.17 
 
 		 288 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.13 
 
 		 346 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7171  monooxygenase  28.9 
 
 		 348 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21228  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12965  oxidoreductase  26.11 
 
 		 381 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  26.9 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  22.19 
 
 		 335 aa  46.2  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0388  Luciferase-like, subgroup  22.19 
 
 		 365 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.178333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>