265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2701 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  92.39 
 
 		 282 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  73.59 
 
 		 287 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  72.76 
 
 		 284 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  55.85 
 
 		 271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  58.96 
 
 		 271 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  54.55 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  56.8 
 
 		 276 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  56.92 
 
 		 272 aa  291  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  56.63 
 
 		 271 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  55.06 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  51.18 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  47.62 
 
 		 257 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  47.43 
 
 		 273 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  47.39 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  46.22 
 
 		 267 aa  205  9e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  47.58 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  47.28 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  51.03 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  38.28 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  43.1 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  50.6 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  34.17 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  33.47 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  34.17 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 285 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  34.17 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  33.75 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 		 275 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  23.93 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4771  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0144083  hitchhiker  0.000189374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.2 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  22.02 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 363 aa  57  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  24.21 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  26.87 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3643  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 284 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  24.2 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.49 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0996  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5612  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00676484  hitchhiker  0.00203627 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  35.48 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  23.48 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3981  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  23.68 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  26.56 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  22.59 
 
 		 345 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  23.18 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0122  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3836  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 298 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.689035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  34.09 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7062  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 258 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  24.46 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 258 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 309 aa  49.7  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  23.66 
 
 		 254 aa  49.3  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.01 
 
 		 387 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  20.97 
 
 		 234 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>