61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0599 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  98.02 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  81.63 
 
 		 197 aa  347  8e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  74 
 
 		 204 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  72.86 
 
 		 204 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  71.36 
 
 		 204 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  75 
 
 		 204 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  75 
 
 		 204 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  75 
 
 		 204 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  74.5 
 
 		 204 aa  295  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  74.5 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  74.5 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  74.5 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  74.5 
 
 		 204 aa  295  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  70.5 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  70.5 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  73.4 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  71 
 
 		 204 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  47.42 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  46.91 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  48.45 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  46.04 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  45.26 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  40.31 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  41.58 
 
 		 213 aa  150  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  31.96 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  31.25 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  30.73 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  33.17 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  29.9 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  32.22 
 
 		 193 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  31.16 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  29.53 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  28.35 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  30.53 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  27.42 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  28.21 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  29.08 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  26.98 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  28.64 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  26.85 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  24.31 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  21.23 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  28.47 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  28.16 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  25.67 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  27.59 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  21.35 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  24.18 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  25.95 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  20.86 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  21.09 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  25.53 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  21.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  21.09 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  20.41 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  24.65 
 
 		 190 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2636  protein of unknown function DUF1239  23.08 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.323637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3028  hypothetical protein  23.08 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>