61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A1517 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  416  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  416  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  416  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  416  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  99.51 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  98.04 
 
 
204 aa  410  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  81.37 
 
 
204 aa  349  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  79.9 
 
 
204 aa  345  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  79.41 
 
 
204 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  82.84 
 
 
204 aa  334  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  82.35 
 
 
204 aa  333  7e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  82.35 
 
 
204 aa  333  7e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  80.88 
 
 
204 aa  328  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  75 
 
 
202 aa  316  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  74.5 
 
 
202 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  74.74 
 
 
197 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  50.27 
 
 
210 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  48.95 
 
 
208 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  49.18 
 
 
210 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  48.63 
 
 
210 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  45.51 
 
 
208 aa  162  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  38.95 
 
 
213 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  37.37 
 
 
213 aa  148  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  33.16 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  33.68 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  33.7 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  35.75 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  29.74 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  31.55 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  31.02 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  28.43 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  29.47 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  30.43 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  30.29 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  27.37 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  30.22 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  28.65 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  27.7 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  31.21 
 
 
190 aa  65.1  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  29.67 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  26.18 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  27.22 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  25.28 
 
 
186 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  26.63 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  26.76 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  23.53 
 
 
185 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  28.26 
 
 
190 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  25.91 
 
 
190 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  27.4 
 
 
190 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  31.63 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  22.08 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  26.06 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  23.53 
 
 
185 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  25.83 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  24.6 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  24.6 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  24.6 
 
 
190 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  23.48 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  23.48 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>