70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3420 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  37.84 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  32.22 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  31.67 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  32.42 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  33.11 
 
 		 190 aa  91.7  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  29.28 
 
 		 204 aa  87.8  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  29.28 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  29.28 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  35.8 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  28.49 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  27.96 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  27.69 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  26.49 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  26.7 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  27.13 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  27.98 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  27.98 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  27.98 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  27.38 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  25.67 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  27.75 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  25.67 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  25.67 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  29.53 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  23.86 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  25.81 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  23.47 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  24.48 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  27.75 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  25.38 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  24.02 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  23.86 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  24.23 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  23.86 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  26.74 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  24.44 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  28.67 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  27.16 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  27.97 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  25.87 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3028  hypothetical protein  25.17 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2636  protein of unknown function DUF1239  25.17 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.323637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  25.13 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  25.87 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  26.06 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  28.91 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  23.5 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  26.32 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  28.91 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  23.5 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  23.88 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  23.88 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  21.39 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  21.67 
 
 		 186 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  21.67 
 
 		 186 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  21.67 
 
 		 186 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  28.67 
 
 		 190 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  21.67 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  21.43 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>