22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3028 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3028  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2636  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.323637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  27.62 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  24.72 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  28.86 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1280  hypothetical protein  32.29 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000165171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  23.24 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  24.19 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  24.59 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  29.66 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  29.66 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  29.66 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  29.66 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  24.62 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0590  hypothetical protein  25.9 
 
 		 170 aa  45.1  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00264254  hitchhiker  0.000000000000495422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  23.72 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  28.97 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  23.08 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  24.31 
 
 		 189 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  24.31 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>