44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5292 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 		 211 aa  431  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  61 
 
 		 205 aa  262  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  55.39 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  54.15 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  54 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  52.63 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  53.27 
 
 		 206 aa  225  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  53.09 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  51.5 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  45 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  38.3 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  32.26 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  29.23 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  28.21 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  28.21 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  30.77 
 
 		 208 aa  85.5  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  28.43 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  29.47 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  31.5 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  29.53 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  31 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  30 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  30.43 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  25.76 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  28.42 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  28.57 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  27.42 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  31.79 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  27.23 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  22.16 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  24.46 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  25.13 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2636  protein of unknown function DUF1239  23.12 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.323637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3028  hypothetical protein  23.12 
 
 		 189 aa  45.1  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  33.75 
 
 		 183 aa  42  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>