66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0293 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  96.67 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  90 
 
 		 210 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  63.4 
 
 		 208 aa  244  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  59.8 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  49.45 
 
 		 197 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  46.91 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  46.91 
 
 		 202 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  47.54 
 
 		 204 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  47.54 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  46.45 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  50.88 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  50.88 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  50.88 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  50.88 
 
 		 204 aa  175  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  50.29 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  50.29 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  50.29 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  50.29 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  48.55 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  48.55 
 
 		 204 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  48.55 
 
 		 204 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  46.33 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  39.11 
 
 		 213 aa  161  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  41.79 
 
 		 213 aa  159  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  33.33 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  33.5 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  27.47 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  31 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  27.27 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  31.5 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.96 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  27.87 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  30.6 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  27.96 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  30.21 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  29.45 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  26.2 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  26.2 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  26.2 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  29.8 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  26.2 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  26.23 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  29.14 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  26.23 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  25.91 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  23.12 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  26.95 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  24.73 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  29.08 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  28.43 
 
 		 189 aa  48.9  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  27.34 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  25.64 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  25.64 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  20 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  22.47 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  23.84 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  24.55 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  23.65 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  22.78 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>