54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0729 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0367  protein of unknown function DUF1239  33.1 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.174327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  31.82 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  28.77 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  26.28 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  27.5 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  23.86 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  26.63 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  25 
 
 
190 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  24.82 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  24.81 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  23.96 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  23.96 
 
 
190 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  26.01 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  23.96 
 
 
190 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  26.02 
 
 
192 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  21.83 
 
 
189 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  21.83 
 
 
189 aa  52  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  24.82 
 
 
196 aa  51.6  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  22.83 
 
 
189 aa  51.2  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  21.79 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  24.11 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  31.33 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  23.4 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  23.86 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  22.7 
 
 
190 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  25.27 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  21.79 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  27.13 
 
 
190 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  23.45 
 
 
229 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  18.68 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  20.86 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  21.43 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  22.78 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  20.86 
 
 
202 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  22.08 
 
 
204 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  22.58 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  22.58 
 
 
204 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  22.58 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  21.48 
 
 
204 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  25.18 
 
 
187 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  25.74 
 
 
213 aa  42  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  23.72 
 
 
206 aa  41.6  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  24.84 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  23.08 
 
 
206 aa  40.8  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>