62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2123 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  30.22 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  30.22 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  28.11 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  25.67 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  29.32 
 
 		 211 aa  67  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  25.13 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  25.13 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  29.45 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  26.63 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  25.54 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  25.54 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  23.53 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  23.72 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  24.06 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  24.02 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  23.72 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  24.06 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  26.09 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  22.7 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  29.17 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  23.08 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  23.08 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  27.05 
 
 		 237 aa  51.2  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  27.5 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  28.26 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  23.87 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  23.53 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  24.73 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  25.98 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2223  hypothetical protein  27.81 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  22.7 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  22.7 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  22.7 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  21.2 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  25.41 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  21.48 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  19.67 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  22.16 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  19.67 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  23.76 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  21.79 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  21.2 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  21.15 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  22.16 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  25.19 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  23.61 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  20.65 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  27.59 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  24.39 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  20.22 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  25.62 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  21.55 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  22.37 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  21.15 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  21.15 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  21.15 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  23.78 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  22.53 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0754  protein of unknown function DUF1239  23.89 
 
 		 209 aa  42  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.496748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  22.92 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  22.22 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>