18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2223 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2223  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  396  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  25.14 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  23.74 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2415  hypothetical protein  22.22 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.989606  normal  0.0564248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  28.57 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  22.65 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  32.14 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  21.91 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  21.91 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  21.91 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  27.52 
 
 
185 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  26.8 
 
 
205 aa  42  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  21.79 
 
 
185 aa  42  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  26.92 
 
 
197 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  26.67 
 
 
183 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  22.78 
 
 
186 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  25.64 
 
 
229 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  21.35 
 
 
186 aa  41.2  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>