55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2712 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  34.11 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  31.25 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  32.56 
 
 
190 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  29.87 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  31.58 
 
 
190 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  26.21 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  27.96 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  27.96 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  31.3 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  26.88 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  28.47 
 
 
190 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  25.81 
 
 
186 aa  58.2  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  27.27 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  30.6 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  26.32 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  25.41 
 
 
185 aa  55.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.16 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  26.9 
 
 
192 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  23.2 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  23.81 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  22.96 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  23.78 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  25.27 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  25.27 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  25.27 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  23.91 
 
 
192 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  25.27 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  24.46 
 
 
185 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  24.46 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  24.46 
 
 
186 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2223  hypothetical protein  25.45 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  23.91 
 
 
186 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  24.73 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  24.82 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  24.87 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  27.59 
 
 
187 aa  45.4  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  29.52 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  22.4 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  22.92 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  23.81 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  23.66 
 
 
183 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  24.68 
 
 
208 aa  42.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  23.61 
 
 
204 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0335  protein of unknown function DUF1239  30 
 
 
269 aa  41.6  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.143778  normal  0.315506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  22.92 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  41.6  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  22.92 
 
 
204 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  22.92 
 
 
204 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>