69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3613 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  74.59 
 
 		 185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  71.2 
 
 		 185 aa  288  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  69.19 
 
 		 185 aa  281  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  71.51 
 
 		 186 aa  277  6e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  71.51 
 
 		 186 aa  277  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  71.51 
 
 		 186 aa  277  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  71.51 
 
 		 186 aa  277  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  69.89 
 
 		 186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  70.43 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  70.43 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  70.43 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  69.35 
 
 		 186 aa  265  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  61.29 
 
 		 186 aa  247  7e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  57.07 
 
 		 186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  57.3 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  31.55 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  31.02 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  28.04 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  29.44 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  27.33 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  22.83 
 
 		 185 aa  72  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  28.49 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  23.63 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  25.93 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  25.93 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  21.39 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  23.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  23.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  23.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  23.08 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  21.43 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  24.49 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  24.49 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  22.53 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  23.65 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  28.26 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  23.13 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  21.23 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  23.37 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  23.37 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  21.55 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  20.27 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  23.12 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  22.58 
 
 		 210 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  22.86 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  21.62 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  22.6 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  22.6 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  22.58 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  24.46 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  21.43 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  21.11 
 
 		 190 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  23.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  19.86 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  21.92 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  21.39 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  24.19 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  24.32 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  24.26 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>