26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0900 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  99.47 
 
 
189 aa  387  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  25 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  30.32 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  30.32 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  25.52 
 
 
192 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  26.12 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  29.1 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  25.15 
 
 
190 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  23.2 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  28.36 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  26.12 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  25.84 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  33.06 
 
 
196 aa  58.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  25.37 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  23.13 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  20 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  25.37 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2415  hypothetical protein  23.76 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.989606  normal  0.0564248 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  21.83 
 
 
186 aa  52  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  21.86 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  25 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  23.88 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0975  hypothetical protein  29.66 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  22.88 
 
 
229 aa  41.6  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  20.83 
 
 
187 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>