66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0873 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  387  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  61.5 
 
 		 190 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  59.79 
 
 		 190 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  60.12 
 
 		 192 aa  216  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  59.36 
 
 		 190 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  58.73 
 
 		 190 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  58.2 
 
 		 190 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  62.28 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  61.68 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  61.08 
 
 		 190 aa  207  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  54.01 
 
 		 190 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  29.17 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  35.34 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  25.71 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  26.21 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  27.69 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  25.81 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  26.75 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  25.53 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  24.32 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  25.53 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  25.56 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  23.13 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  23.13 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  24.48 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  28.02 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  26.67 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  23.89 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  26.01 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  26.2 
 
 		 229 aa  52  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  27.17 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2415  hypothetical protein  18.54 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.989606  normal  0.0564248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  21.62 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  27.17 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  28.34 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  22.92 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  22.58 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  24.18 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  22.58 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  22.58 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  22.58 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  21.98 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  24.18 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  23.44 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  20.43 
 
 		 186 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  29.37 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  27.97 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  27.97 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  24.48 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  27.97 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  25.77 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  22.99 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  26.06 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  23.08 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  21.39 
 
 		 208 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  22.73 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  21.28 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  22.54 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>