72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0860 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  66.32 
 
 		 190 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  69.47 
 
 		 190 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  68.95 
 
 		 190 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  67.37 
 
 		 190 aa  267  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  66.84 
 
 		 190 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  66.84 
 
 		 190 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  59.52 
 
 		 192 aa  231  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  53.44 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  58.68 
 
 		 190 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  57.49 
 
 		 190 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  28.43 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  29.21 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  31.65 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  31.3 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  23.2 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  23.2 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  28.36 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  28.36 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  29.77 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  25.41 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  25.58 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  27.1 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  23.33 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  22.4 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  26.67 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  27.13 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  22.22 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  25.65 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  23.08 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  26.15 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  28.08 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  28.08 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  28.08 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  27.5 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  28.34 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  25.17 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  21.11 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  26.25 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  22.7 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  27.34 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  26.03 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  24.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  24.67 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  28.67 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  23.4 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3028  hypothetical protein  25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2636  protein of unknown function DUF1239  25 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.323637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2415  hypothetical protein  17.39 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.989606  normal  0.0564248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  23.64 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  20.99 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  24.31 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  21.55 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  21.55 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  21.55 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  21.55 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  24.31 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  20.56 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  20.56 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  20.56 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  24.43 
 
 		 189 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1803  hypothetical protein  31.25 
 
 		 382 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0714951  hitchhiker  0.000605155 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  20.56 
 
 		 186 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  22.99 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>