72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5032 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  394  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  97.89 
 
 
190 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  61.68 
 
 
192 aa  223  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  57.89 
 
 
188 aa  221  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  62.43 
 
 
190 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  55.32 
 
 
190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  59.89 
 
 
190 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  57.37 
 
 
190 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  56.84 
 
 
190 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  58.08 
 
 
190 aa  207  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  54.26 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  31.68 
 
 
196 aa  96.3  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  30.05 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  29.68 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  32.93 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  26.49 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  26.49 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  27.46 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  27.46 
 
 
195 aa  61.6  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  25.79 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  27.78 
 
 
204 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  26.9 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  27.78 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  26.78 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  26.39 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  28.03 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  26.67 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  21.98 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  26.78 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  24.87 
 
 
197 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  28.76 
 
 
204 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  23.24 
 
 
185 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  28.1 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  28.1 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  28.1 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  23.28 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  22.16 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  22.16 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  30 
 
 
229 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  22.16 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  22.16 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  23.68 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  22.16 
 
 
186 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.97 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  24.36 
 
 
191 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  22.54 
 
 
186 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  26.51 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  24.29 
 
 
185 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  26.49 
 
 
187 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  26 
 
 
174 aa  48.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  25.77 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  22.51 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  20.74 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  27.78 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  26.74 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  24 
 
 
208 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  22.7 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  27.37 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  23.78 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  23.57 
 
 
187 aa  42.4  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  22.62 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  26.22 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  24.32 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  23.81 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  23.83 
 
 
188 aa  41.2  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>