76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_12820 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  393  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  59.38 
 
 
190 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  57.29 
 
 
190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  57.59 
 
 
188 aa  228  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  58.33 
 
 
190 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  57.29 
 
 
190 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  62.28 
 
 
190 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  60.48 
 
 
190 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  56.25 
 
 
190 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  61.68 
 
 
190 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  56.25 
 
 
190 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  32.54 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  31.25 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  33.55 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  28.08 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  30.65 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  30.65 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0900  hypothetical protein  24.31 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0869  hypothetical protein  24.86 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  28.47 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  31.96 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  26.39 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  26.92 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  28.85 
 
 
174 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  26.92 
 
 
202 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  27.07 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  27.96 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  25.95 
 
 
197 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  22.86 
 
 
186 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  25.41 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  26.9 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  26.52 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  27.01 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  25.58 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  21.39 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  21.39 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  26.57 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  26.57 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  21.39 
 
 
186 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  26.57 
 
 
204 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  26.57 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  22.51 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  26.44 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2415  hypothetical protein  19.37 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.989606  normal  0.0564248 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  25.77 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  21.39 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  32.11 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  24.61 
 
 
204 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  25 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  19.02 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  21.31 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  23.6 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  27.78 
 
 
185 aa  45.1  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  24.68 
 
 
189 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  22.28 
 
 
189 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  20.69 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  19.86 
 
 
185 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  22.16 
 
 
191 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  22.16 
 
 
189 aa  42.4  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  22.35 
 
 
186 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  25.88 
 
 
187 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  25.88 
 
 
187 aa  42  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  20.56 
 
 
185 aa  41.6  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  22.16 
 
 
189 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  22.16 
 
 
185 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  22.49 
 
 
188 aa  41.6  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  22.41 
 
 
208 aa  41.2  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1803  hypothetical protein  26.52 
 
 
382 aa  41.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0714951  hitchhiker  0.000605155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  22.35 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  22.35 
 
 
186 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>