57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0277 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  96.28 
 
 		 188 aa  352  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  67.55 
 
 		 192 aa  264  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  64.74 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  64.74 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  64.74 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  64.74 
 
 		 191 aa  255  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  64.74 
 
 		 191 aa  254  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  62.63 
 
 		 191 aa  248  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  68.28 
 
 		 189 aa  245  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  62.23 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  62.23 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  67.72 
 
 		 189 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  63.44 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  63.44 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  39.68 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  28.89 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  27.17 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  32.88 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  28.49 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  26.09 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  25.54 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  25 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  25.68 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  21.2 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  25.52 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  22.04 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  22.04 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  22.04 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  23.56 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  23.56 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  22.04 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  24 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  23.04 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  24.66 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  21.39 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  22.58 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  22.07 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  22.07 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  26.97 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  24.7 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  23.86 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  23.08 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  24.56 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  29.37 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  24.7 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  25.97 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5301  hypothetical protein  35.48 
 
 		 178 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.231819 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  25.41 
 
 		 190 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  24.86 
 
 		 190 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>