86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0729 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  77.17 
 
 		 185 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  74.59 
 
 		 185 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  74.05 
 
 		 185 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  69.89 
 
 		 186 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  69.89 
 
 		 186 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  69.89 
 
 		 186 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  69.89 
 
 		 186 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  70.37 
 
 		 186 aa  279  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  68.28 
 
 		 186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  67.74 
 
 		 186 aa  270  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  67.74 
 
 		 186 aa  270  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  67.74 
 
 		 186 aa  270  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  59.68 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  55.98 
 
 		 186 aa  223  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  54.05 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03190  hypothetical protein  31.91 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4540  hypothetical protein  31.55 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0565  hypothetical protein  28.04 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2106  hypothetical protein  25.14 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2889  hypothetical protein  29.53 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.903337  normal  0.225255 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0501  hypothetical protein  28.31 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131901  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03661  hypothetical protein  22.03 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  26.63 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3635  hypothetical protein  22.78 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.61697  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4364  hypothetical protein  23.33 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0921262  normal  0.17011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002406  YrbK protein  22.6 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3812  hypothetical protein  23.45 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.271205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3676  hypothetical protein  22.78 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.228825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  26.78 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3654  hypothetical protein  24.84 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0277  hypothetical protein  22.07 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0645797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3578  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3614  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.150228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3509  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3507  hypothetical protein  22.22 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  26.23 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0284  hypothetical protein  22.07 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.237745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3687  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3571  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3392  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  23.63 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4521  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.424898  normal  0.731411 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0508  protein of unknown function DUF1239  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3495  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0501  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.508858  normal  0.406896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03064  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000319366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03015  hypothetical protein  22.76 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0444  hypothetical protein  22.56 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0508  hypothetical protein  22.56 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  26.53 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  25.41 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  25.86 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  25.68 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  27.81 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  27.81 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  25.88 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  26.71 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  24.59 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  23.46 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  24.85 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  22.91 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  23.44 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  23.5 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  22.1 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  22.82 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  24.26 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  23.49 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  21.3 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  23.53 
 
 		 204 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  28.7 
 
 		 204 aa  42  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  21.09 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  20.75 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  23.19 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  21.92 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  24.18 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  18.78 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  22.46 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  22.46 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>