61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6118 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  93.63 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  93.14 
 
 
204 aa  394  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  92.16 
 
 
204 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  93.63 
 
 
204 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  93.63 
 
 
204 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  93.63 
 
 
204 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  81.86 
 
 
204 aa  334  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  81.37 
 
 
204 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  81.37 
 
 
204 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  81.37 
 
 
204 aa  333  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  80.88 
 
 
204 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  80.88 
 
 
204 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  80.88 
 
 
204 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  80.88 
 
 
204 aa  331  4e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  73.89 
 
 
202 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  73.4 
 
 
202 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  74 
 
 
197 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  45.99 
 
 
210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  45.45 
 
 
210 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  47.75 
 
 
208 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  45.99 
 
 
210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  37.17 
 
 
213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  36.65 
 
 
213 aa  144  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  33.7 
 
 
229 aa  111  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  31.44 
 
 
201 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  30.3 
 
 
206 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  30.77 
 
 
206 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  30.26 
 
 
205 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  30.26 
 
 
205 aa  95.1  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  89.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  28.65 
 
 
237 aa  88.2  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  28.88 
 
 
233 aa  88.2  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  28.65 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  28.73 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  29.65 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25.13 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  24.44 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  29.08 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  25.82 
 
 
193 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  29.41 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  26.37 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  24.06 
 
 
231 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  28.76 
 
 
190 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3374  hypothetical protein  30.43 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.327659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  30.14 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  26.57 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  28.77 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0744  hypothetical protein  32.63 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00899887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  25.76 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  27.27 
 
 
196 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  22.15 
 
 
185 aa  47  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  26.53 
 
 
190 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  25.27 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  25.27 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  25.27 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  27.97 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  21.09 
 
 
186 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  24.67 
 
 
185 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  23.61 
 
 
199 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>