61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0878 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 
193 aa  383  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4450  hypothetical protein  30.56 
 
 
190 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0612162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  35.8 
 
 
193 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4144  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  35.34 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0994  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0955  hypothetical protein  30.92 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  30.16 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0962  hypothetical protein  31.58 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  31.12 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12820  hypothetical protein  33.09 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  28.49 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  33.86 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4260  hypothetical protein  30.36 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  30.11 
 
 
236 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  33.86 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  30 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  31.47 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  26.46 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  26.98 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  29.26 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  28.77 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  31.58 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  35.71 
 
 
190 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0860  hypothetical protein  31.65 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  33.33 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  27.32 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  28.02 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  26.97 
 
 
191 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  27.08 
 
 
237 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
233 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  26.92 
 
 
204 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  26.92 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  27.23 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  30.34 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3176  hypothetical protein  27.32 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  26.21 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  26.21 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  26.21 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  25.52 
 
 
204 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0824  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0924  hypothetical protein  24.44 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.868598  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1490  hypothetical protein  24.47 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0505415  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  22.35 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  22.47 
 
 
210 aa  45.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  22.29 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  22.29 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  22.47 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2227  hypothetical protein  25.9 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  19.54 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  23.81 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  22.87 
 
 
185 aa  41.6  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  20.11 
 
 
189 aa  41.2  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>