43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4235 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  58.88 
 
 		 205 aa  251  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  57.71 
 
 		 205 aa  250  8.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  58.76 
 
 		 236 aa  246  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  57.21 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  57.65 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  54 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  53.03 
 
 		 237 aa  227  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  54.59 
 
 		 205 aa  218  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  43.65 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  32.81 
 
 		 197 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  38.5 
 
 		 231 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  31.96 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  34.78 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  31.79 
 
 		 204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  30.73 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  31.61 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  32.39 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  32.39 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  32.39 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  31.64 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  35.75 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  31.35 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  27.47 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  27.47 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  29.19 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  26.24 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  25.95 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  31.47 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  26.32 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  28.95 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25.31 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  32.5 
 
 		 187 aa  50.1  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  27.62 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>