45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4130 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  99.03 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  70.73 
 
 		 205 aa  305  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  66.32 
 
 		 205 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  62.56 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  61.14 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  58.08 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  57.65 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  53.09 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  48.98 
 
 		 233 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  37.5 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  33.68 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  30.73 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  30.21 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  33.15 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  31.82 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  31.31 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  29.69 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  33.68 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  33.33 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  32.79 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  30.11 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  31.38 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  31.69 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  28.21 
 
 		 229 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  33.86 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  25.67 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  27.33 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  24.16 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  24.18 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  31.9 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0957  protein of unknown function DUF1239  23.33 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.296893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  23.72 
 
 		 186 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>