66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0306 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  72.06 
 
 		 208 aa  298  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  64.43 
 
 		 210 aa  255  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  63.08 
 
 		 210 aa  254  7e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  62.05 
 
 		 210 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  50.27 
 
 		 197 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  50.81 
 
 		 204 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  49.73 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  49.19 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  45.69 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  45.18 
 
 		 202 aa  188  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  50.29 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  180  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  47.74 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  50.29 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  50.29 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  47.98 
 
 		 204 aa  175  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  41.05 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  40.53 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  35.45 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  34.41 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  34.41 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  32.47 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  30.61 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  32.81 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  31.72 
 
 		 205 aa  101  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  30.32 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  29.5 
 
 		 205 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  29.59 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  29.28 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  34.27 
 
 		 190 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.46 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  28.14 
 
 		 231 aa  72.8  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2790  hypothetical protein  27.62 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0132705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0878  protein of unknown function DUF1239  23.47 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000052422  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  26.02 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  26.02 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  26.02 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  26.02 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0718  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.388737  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  31.33 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02230  hypothetical protein  26.26 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4237  hypothetical protein  25.44 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.830949  hitchhiker  0.000311603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0729  hypothetical protein  24.85 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0759  hypothetical protein  25.42 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.855152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  25 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  24.23 
 
 		 186 aa  45.1  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1204  hypothetical protein  23.56 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0761  hypothetical protein  23.56 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0492  hypothetical protein  23.12 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0873  hypothetical protein  22.65 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  23.71 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  23.71 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  26.67 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0536  hypothetical protein  20.99 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.546303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57910  hypothetical protein  24.31 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5032  hypothetical protein  23.61 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0247883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  23.98 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0673  hypothetical protein  23.73 
 
 		 189 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3613  hypothetical protein  24.26 
 
 		 185 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.261264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>