53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1909 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1909  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  437  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1614  protein of unknown function DUF1239  82.38 
 
 		 213 aa  360  9e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0293  protein of unknown function DUF1239  39.11 
 
 		 210 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0411  hypothetical protein  38.61 
 
 		 210 aa  157  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00714649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0266  protein of unknown function DUF1239  38.12 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0329  hypothetical protein  41.45 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4119  hypothetical protein  40.31 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0599  protein of unknown function DUF1239  40.31 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0385161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0527  hypothetical protein  37.77 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.959289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2706  hypothetical protein  37.7 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.039659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2848  hypothetical protein  37.17 
 
 		 204 aa  148  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0306  hypothetical protein  40.53 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0489  hypothetical protein  38.42 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2799  hypothetical protein  37.85 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2174  hypothetical protein  37.85 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2788  hypothetical protein  37.85 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.34645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0768  hypothetical protein  37.89 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0600  hypothetical protein  37.89 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402593  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0584  hypothetical protein  37.89 
 
 		 204 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0073  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2945  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1517  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0358  hypothetical protein  38.12 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3104  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6118  hypothetical protein  37.85 
 
 		 204 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3488  protein of unknown function DUF1239  30 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4130  hypothetical protein  30 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0152  hypothetical protein  29.08 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4235  hypothetical protein  30.77 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.165546  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0139  hypothetical protein  25.89 
 
 		 229 aa  92  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4783  hypothetical protein  27.72 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4106  hypothetical protein  29.57 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4896  hypothetical protein  29.69 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0185409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6049  hypothetical protein  26.67 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3420  hypothetical protein  27.69 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000640178  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3807  putative transmembrane protein  28.28 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.184987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5292  protein of unknown function DUF1239  25.76 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0184  hypothetical protein  23.86 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0087  hypothetical protein  25.16 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102868  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2712  hypothetical protein  22.96 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0676  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0807822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3346  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0369087  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3308  hypothetical protein  25.52 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00258939  normal  0.764228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0675  hypothetical protein  26.8 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271395  normal  0.100125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1174  hypothetical protein  30.08 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0710  protein of unknown function DUF1239  26.15 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.673101  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0689  hypothetical protein  26.15 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0070869  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3665  hypothetical protein  26.15 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000851381  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0719  hypothetical protein  26.15 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2123  hypothetical protein  23.62 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3085  hypothetical protein  25.53 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.998708  normal  0.196935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3958  hypothetical protein  25.77 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0729  hypothetical protein  25.74 
 
 		 186 aa  42  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>